휴대용 DNA증폭기 MiniPCRTM mini8 Thermal Cycler의 성능 검토

DOI QR코드

DOI QR Code

권한솔;박현철;이경명;안상현;오유리;안으리;정주연;임시근
Kwon, Han-Sol;Park, Hyun-Chul;Lee, Kyungmyung;An, Sanghyun;Oh, Yu-Li;Ahn, Eu-Ree;Jung, Ju Yeon;Lim, Si-Keun

  • 투고 : 2015.11.24
  • 심사 : 2016.04.20
  • 발행 : 2016.04.25

초록

최근 손안에 들어올 정도로 크기가 작아 범죄현장 등에서 사용이 가능하며, 다른 일반적인 장비들에 비해 가격이 1/10이하로 저렴하여 누구나 사용할 수 있는 MiniPCRTM mini8 Thermal Cycler (Amplyus, Cambridge, MA, USA)가 개발되었다. 본 연구에서는 DNA감식에 일반적으로 사용되고 네 가지 종류의 상염색체 STR 다중증폭 키트들과 한 종류의 Y 염색체 STR 증폭키트, 그리고 미토콘드리아 DNA HV1/HV2의 염기서열 분석법을 사용하여 MiniPCRTM mini8 Thermal Cycler의 성능을 Applied Biosystems사의 GeneAmp® PCR system 9700와 비교하였다. STR 다중증폭키트 키트들의 민감도와 증폭 불균형 정도를 비교한 결과 두 PCR 장비에서 큰 차이가 없었으며, 미토콘드리아 DNA HV1/HV2의 염기서열 분석 결과도 동등하였다. MiniPCRTM mini8 Thermal Cycler는 DNA 감식 실험실은 물론이고, 가격이 저렴해 학교와 개인이 간편하게 사용할 수 있으며, 휴대가 간편해 차량이나 야외에서 활용 될 수 있을 것으로 기대된다.

키워드

MiniPCRTM mini8 Thermal Cycler;GeneAmp®PCR system 9700;performance;STR multiplex kits;mtDNA HV1/HV2

참고문헌

  1. Bartlett, J. M. S. and Stirling, D. "A Short History of the Polymerase Chain Reaction". PCR Protocols. Methodsin Molecular Biology, 226 (2nd ed.). pp. 3-6. doi: 10.1385/1-59259-384-4:3. ISBN 1-59259-384-4 (2003). https://doi.org/10.1385/1-59259-384-4:3
  2. Newton, C. R. Graham, A., Heptinstall, L. E., Powell, S. J., Summers, C., Kalsheker, N., Smith, J. C., and Markham, A. F., Nucleic Acids Research, 17(7), 2503-2516 (1989). https://doi.org/10.1093/nar/17.7.2503
  3. Stemmer, W. P., Crameri, A., Ha, K. D., Brennan, T. M., and Heyneker, H. L., Gene, 164(1), 49-53 (1995). https://doi.org/10.1016/0378-1119(95)00511-4
  4. Hayden, M. J., Nguyen, T. M., Waterman, A., and Chalmers, K. J., BMC Genomics, 9, 80, doi: 10.1186/1471-2164-9-80 (2008). https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-80
  5. Bartlett, J. M. J. Forensic Sci., 51, 253-265 (2006). https://doi.org/10.1111/j.1556-4029.2006.00046.x
  6. Hammond, H. A., Jin, L., Zhong, Y., Caskey, C. T., and Chackraborty, R., Am J. Hum. Genet., 55, 175-189 (1994).
  7. Tautz, D., Nucleic Acids. Res., 17, 6463-6471 (1989). https://doi.org/10.1093/nar/17.16.6463
  8. Lee, E. J., Choung, C. M., Moon, S. H., Chung, J. Y., Jin, G. N., Kim, M. I., Lee, J. Y., Kim, S. H., and Lee, Y. H., Korean J. Forensic Sci., 15(1), 87-90 (2014).

피인용 문헌

  1. 1. DNA-based techniques for authentication of processed food and food supplements vol.240, 2018, doi:10.5806/AST.2016.29.2.79
  2. 2. Simple and rapid identification of saliva by detection of oral streptococci using direct polymerase chain reaction combined with an immunochromatographic strip vol.33, 2018, doi:10.5806/AST.2016.29.2.79