Implementation of XML Generator for Exchanging Integrated Motif Resources

통합 모티프 자원 교환을 위한 XML 생성기 구현

  • Lee, Bum-Ju (Database Laboratory, Chungbuk National University) ;
  • Kim, Young-Gyun (Database Laboratory, Chungbuk National University) ;
  • Choi, Eun-Sun (Database Laboratory, Chungbuk National University) ;
  • Ryu, Keun-Ho (Database Laboratory, Chungbuk National University)
  • 이범주 (충북대학교 데이터베이스연구실) ;
  • 김영균 (충북대학교 데이터베이스연구실) ;
  • 최은선 (충북대학교 데이터베이스연구실) ;
  • 류근호 (충북대학교 데이터베이스연구실)
  • Published : 2003.05.16

Abstract

최근 생물정보학 분야에서는 이질적인 데이터 형식으로 제공되는 모티프 자원들을 하나의 자원으로 통합하고자 하는 많은 연구가 진행되고 있다. 이러한 통합을 위해 웹 기반 cross-reference를 이용한 논리적 통합이 주로 사용되어져 왔고, 이러한 이질적인 데이터의 상호교환을 위한 표준 형식으로 XML을 정의하여 이응하기 시작하였다. 피러나 이러한 웹 기반 cross-reference를 이용한 논리적 통합은 복잡한 질의 처리 문제, 중복된 데이터베이스 핸들링 문제 등을 지니고 있다. 따라서 이 논문에서는 이러한 문제점들을 개선하기 위해 물리적으로 모티프 자원들을 하나의 통할 데이터베이스로 구축하였고, 통합된 모티프 자원의 표준적 상호 교환을 위해 XML 생성기를 구현하였다.

Keywords