An Extensible Text Mining Technique for the Extraction of Protein-Protein Interaction

단백질 상호작용 추출을 위한 확장성을 가진 텍스트 마이닝 기법

  • 이현철 (충북대학교 정보산업공학과) ;
  • 여은주 (충북대학교 경영정보학) ;
  • 강희영 (충북대학교 생명과학) ;
  • 조완섭 (충북대학교 경영정보학) ;
  • 김학용 (충북대학교 생명과학) ;
  • 유재수 (충북대학교 전기전자 컴퓨터공학부)
  • Published : 2004.04.01

Abstract

단백질간의 상호작용에 대한 연구는 생물학적 프로세스를 이해하기 위해 중요한 부분이다. 이러한 단백질간의 상호작용에 대한 정보는 주로 생명과학 관련 연구논문에 존재하지만 컴퓨터로 자동으로 처리하여 상호작용에 관안 정보를 추출할 수 있기 위해서는 텍스트 마이닝 기술이 적용되어야 한다 바이오 텍스트 마이닝에서 대두되고 있는 중요한 쟁점은 대용량의 연구논문에서 필요한 정보를 어떻게 효율적으로 정확하게 추출할 것인가에 대한 내용이다. 또한, 관심이 있는 단백질의 종류나 관련성을 표시하는 문장내 패턴의 다양성을 수용하기 위하여 개발하는 시스템의 확장성을 높이는 것도 소프트웨어 공학적인 측면에서 중요한 이슈이다 이 논문의 목적은 생물학적 내용을 담고 있는 연구논문으로부터 단백질간의 상호작용을 추출하는 확장성을 가진 텍스트 마이닝 기법을 제안하는데 있다.

Keywords