Isolation and Characterization of an Agar-degrading Bacterium, Isolated from The Sea Water

  • 문현식 (제주대학교 해양과학대학 해양생산과학전공) ;
  • 홍승현 (제주대학교 해양과학대학 해양생산과학전공) ;
  • 허문수 (제주대학교 해양과학대학 해양생산과학전공)
  • Published : 2005.10.27

Abstract

An agar degrading bacterium, This strain was isolated from sea water in Jeju. The strain is Gram-negative, rod and strictly aerobe for growth. The identification bases on the 16S rRNA gene sequencing showed that the strain was closely related to the genus Agariovarans sp. and named Agariovorans sp. JA1. The strain grew on agar as a sole carbon and energy source and produced an extra cellular agarase. For the increase of agarase productivity, 0.5% agar, yeast extract and $NaNO_3$ were used as carbon, organic and inorganic nitrogen source, respectively. For effective production of agarase and growth, the pH, temperature and NaCl concentration were was pH 7, $25^{\circ}C$ $^{\sim}$ $30^{\circ}C$ and 2%, respectively.

한천분해 세균은 제주 연안의 해수로부터 분리되어졌다. 균주는 Gram 음성 간균이며, 절대 호기성 세균이다. 균주는 agarase를 생성하여 한천을 분해하는 것으로 관찰되었다. 균주의 생화학적 특성과 16S rRNA 유전자 염기서열 분석한 결과 Agarivorans속으로 동정 되었다. 그래서 Agarivorans sp. JA1이라 명명하였다. agarase의 최적 생산을 위한 agar농도는 0.5%이며, pH, 온도와 NaCl 농도는 각각 pH 7, $25^{\circ}C$ $^{\sim}$ $30^{\circ}C$와 2%였다. 유기태과 무기태는 각각 yeast extract와 $NaNO_3$를 첨가 할 경우 agarase 생성이 가장 좋은 것으로 사료되었다. Agarase의 최적 생산 활성 측정은 DNS법(3,5-dinitrosalicyclic acid procedure)을 이용하여 환원당 값을 산출하였고, 50000(U/L)이상 나왔다.

Keywords