Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference (한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집)

Korean Society of Computer Information (한국컴퓨터정보학회)
권호 표지

A Web-Based High Performance Multiple Sequence Alignment System Design and Implementation

웹 기반 고성능 다중서열정렬시스템 설계 및 구현

  • Kim, Tae-Kyung (Korean Bioinformation Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology) ;
  • Kim, Hun-Gi (Dept. of Bio-Information Technology, Chungbuk National University) ;
  • Choi, Chi-Hwan (Dept. of Bio-Information Technology, Chungbuk National University) ;
  • Jung, Seung-Hyun (Dept. of Information Industrial Engineering, Chungbuk National University) ;
  • Hou, Bo-Kyeng (Korean Bioinformation Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology) ;
  • Cho, Wan-Sup (Dept. of Management Information Systems, u-BIZ BK21, Chungbuk National University)
  • 김태경 (한국생명공학연구원 국가생명연구자원정보센터) ;
  • 김훈기 (충북대학교 바이오정보기술학과) ;
  • 최치환 (충북대학교 바이오정보기술학과) ;
  • 정승현 (충북대학교 정보산업공학과) ;
  • 허보경 (한국생명공학연구원 국가생명연구자원정보센터) ;
  • 조완섭 (충북대학교 경영정보학과)
  • Published : 2010.07.08
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

다중서열정렬 알고리즘은 생명정보학 분야에서 서열기반의 계통분류 분석에 가장 많이 사용되며, 가장 대표적인 공개 프로그램은 ClustalW로 사용자가 로컬시스템에 설치하여 이용할 수 있다. 그러나 실제로 사용자들이 ClustalW을 설치한 후, 서열데이터의 준비, 가공, 처리 및 타 시스템과 연동 등과 같은 작업을 하는데 여러 가지 어려움이 있다. 따라서 본 논문에서는 다중서열정렬 작업을 편리하고 빠르게 수행할 수 있는 웹기반의 고성능 다중서열정렬시스템을 제안한다. 제안된 시스템의 특징은, (1) Inter-Query 라우팅 알고리즘을 통해 다수의 PC 자원을 효율적으로 활용하여 계산 성능을 극대화하였으며, (2) 사용자 편의성을 고려한 웹인터페이스의 제공을 통해 개인화된 데이터관리, 실시간 모니터링, 데이터 편집 등을 지원하여 사용자가 손쉽게 서열데이터의 수집, 관리 및 처리할 수 있도록 지원한다.

Keywords