Proceedings of the Korea Contents Association Conference (한국콘텐츠학회:학술대회논문집)

The Korea Contents Association (한국콘텐츠학회)
권호 표지

Implementing System for Dynamic Constructing and Clustering on KEGG Pathway Network

KEGG 패스웨이 네트워크 동적 구축 및 클러스터링 시스템 개발

  • Seo, Dongmin (Biomedical HPC Research Center, Korea Institute of Science and Technology Information) ;
  • Lee, Min-Ho (Biomedical HPC Research Center, Korea Institute of Science and Technology Information) ;
  • Yu, Seok Jong (Biomedical HPC Research Center, Korea Institute of Science and Technology Information)
  • 서동민 (한국과학기술정보연구원 생명의료HPC연구센터) ;
  • 이민호 (한국과학기술정보연구원 생명의료HPC연구센터) ;
  • 유석종 (한국과학기술정보연구원 생명의료HPC연구센터)
  • Published : 2015.05.01
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Abstract

최근 유전체학, NGS(Next Generation Sequencing) 기술, IT/NT 장비의 발전 등에 따라 방대한 양의 바이오-메디컬 데이터가 생산되고, 이에 따라 빅데이터를 활용한 헬스케어 산업이 급속히 발달하고 있으며, 이와 관련된 빅데이터 기술은 국민의 건강 증대와 건강한 고령 삶을 제공하는 핵심 기술로 급부상하고 있다. 패스웨이는 단백질, 유전자, 세포 등의 생체적 요소 간의 역학관계 혹은 상호작용 등을 네트워크 형식으로 표현한 생물학적 심층지식으로, 바이오-메디컬 빅데이터 분석에 있어서 널리 활용되고 있다. 하지만 패스웨이는 매우 다양한 형태를 갖고 용량이 매우 큰 빅데이터로 이를 분석하는데 많은 시간이 소요된다. 그래서 본 논문에서는 세계적으로 가장 우수하고 방대한 양의 패스웨이를 제공하는 KEGG 패스웨이 데이터베이스로부터 사용자가 관심 갖는 패스웨이만을 자동 수집하고 패스웨이 간 계층구조를 기반으로 네트워크를 구성 후, 해당 패스웨이 네트워크에 대한 클러스터링과 핵심 패스웨이 선정을 통해 패스웨이 간의 역학관계 또는 상호작용을 직관적으로 분석할 수 시스템을 제안했다.

Keywords