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Construction of a biological network using recursive adaptive partitioning

재귀적 적응 분할 방식을 사용한 생물학적 네트워크의 구축

  • Lee, Sunyoung (School of Electrical Engineering Korea University) ;
  • Lee, Minhyeok (School of Electrical Engineering Korea University) ;
  • Kang, Yeong Seon (Department of Business Administration University of Seoul) ;
  • Seok, Junhee (School of Electrical Engineering Korea University)
  • 이선영 (고려대학교 전기전자공학부) ;
  • 이민혁 (고려대학교 전기전자공학부) ;
  • 강영선 (서울시립대학교 경영학부) ;
  • 석준희 (고려대학교 전기전자공학부)
  • Published : 2016.04.29

Abstract

본 논문에서는 생물학적 네트워크 구성을 개선하기 위해서 노이즈의 영향으로 상관관계가 명확하게 나타나지 않았던 기존의 방법을 보완할 수 있는 새로운 방법을 제안한다. 제안된 방법은 재귀적응분할 방법으로 상관행렬에서 노이즈의 영향을 줄여 표본간의 상관관계를 명확히 보여 줄 수 있다. 시뮬레이션 결과 네트워크 구성의 오류를 15% 줄여 기존의 방법보다 향상된 결과가 나타났다. 또한, 유전자 발현 데이터를 이용한 실례 연구에서는 원 데이터에 잘 나타나지 않았던 조건별 네트워크 구성이 제안된 방법으로는 잘 분리되어 있는 것을 확인 할 수 있었다. 본 논문에서 제안된 방법은 유전자 발현 데이터 분석 등의 생물학적 네트워크 구성에 활용될 수 있을 것으로 기대한다.

Keywords