Abstract
There are three pseudourdine ($Psi$)bases in the E. coli $tRNA^{phe}$ In order to study the function of the pseudouridine bases in the $tRNA^{phe}$, changes of bases $tRNA^{phe}$ gene to other bases were undertaken by the site-specific mutagenesis. Site-specific mutagenesis of T in the pheW gene, a $tRNA^{phe}$ gene of E. coli, corresponding to the baseat the No.32 position to C and also T corresponding to the base at the No.39 position to C were performed using Kunkel's uracil-containing template method. Identification of mutants were undertaken by the KNA sequencing techniques of the mutated pheW genes and activities of the mutated pheW genes complementing to E. coli NP37 mutant($pheS^{-ts}$) using the recombinant plasmid containing the mutated genes. Neither NP37 harboring pheW gene mutated at No.32 position nor NP37 harboring pheW gene mutated at No.39 position can be grown at non-permissive temperature. The result means that both mutated pheW genes can not complement to E. coli NP37, and that the pseudouridine bases are essential to the activity of the E. coli $tRNA^{phe}$ in vivo.
E. coli의 $tRNA^{phe}$내에는 세 개의 psiudouridine 염기들이 존재한다. 이 $tRNA^{phe}$내의 pseudouridine 염기들의 기능을 연구하기 위하여 부위특이적 돌연변이를 이용하여 $tRNA^{phe}$ 유전자의 염기를 다른 염기로 치환시켰다. E. coli $tRNA^{phe}$ 유전자들 중 하나인 phe W 유전자내에서 32번에 해당하는 T 염기를 C 염기로 39번 T 염기를 C 염기로 Kunkel이 개발한 부위특이적 돌연변이 방법을 사용하여 각각 치환시켰다. DNA 염기서열을 결정함으로써 돌연변이체를 확인하였으며, 이들 돌연변이 유전자를 함유한 재조합 플라스미드를 이용하여 돌연변이된 phe W 유전자들의 E. Coli NP37($pheS^{-ts}$)에 대한 complementation 활성을 조사하였다. 32번 위치가 변이된 pheW 유전자 뿐만아니라 39번 위치가 변이된 phe W 유전자를 함유한 E. coh NP37들은 모두 non-permissive temperature에서 자라지 못하였다. 이 결과는 변이된 pheW 유전자들이 E. coli NP37을 complementation 할 수 없으며, 또 pseudouridine 염기들이 생체내에서 E. coli $tRNA^{phe}$의 활성에 필수적이라는 것을 의미한다.