Parasites, Hosts and Diseases

The Korea Society for Parasitology and Tropical Medicine (대한기생충학·열대의학회)
권호 표지

Restriction endonuclease analysis of mitochondrial DNA of Acanthamoebn sp. YM-4 (Korean isolate)

Acanrhamoeba sp. YM-4의 미토콘드리아 DNA의 RFLP분석

  • Sin, Ho-Jun (Department of Microbiology, Ajou University School of Medicine) ;
  • Im, Gyeong-Il (Department of Parasitology, College of Medicine, Yonsei University) ;
  • Jeon, Gwang-U (Department of Zoology, University of Tennesses)
  • 신호준 (아주대학교 의과대학 미생물학교실) ;
  • 임경일 (연세대학교 의과대학 기생충학교실) ;
  • 전광우 (미국 Tennessee 대학교 동물학과)
  • Published : 1997.06.01
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Abstract

Acanthnmoebn sp. YM-4 is simitar to A. culbertsoni based upon morphological characteristics of trophozoites and cysts. However, based on other characteristics, pathogenicity to mice, in uitro cytotoxicity and isoenzyme patterns, Acanthomoebo sp. YM- 4 was quite different from A. culbertsoni. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of mtDNA is useful in the classification of members belonging to the genus Acanthcmoebn. Therefore, in this study, RFLP analysis of Acnnthcmoeba mtDNAs was accomplished using five restriction enzymes: Hnelll, Hinull, Clcl, Pudl and ScE. Each restriction enzyme produced approximately 3-15 fragments (range: from 0:6 kip to 34.4 kbp) . The mtDNA genome size, calculated by the summation of restriction fragments, averaged 46.4 kbp in Acnnthamoeba sp. YM-4,48.3 kbp in A. culbertsoni and 48.8 kbp in A. polyphaic, respectively. Digested mtDNA fragments of Accnthcmoeba sp. YM-4 contained nine and seven same size fragments, respectively, from a total of 67 and 69 fragments observed in A. culbertsoni and A. polyphcgn. An estimate of the genetic divergence was 10.1% between Acanthamoebc sp. YM-4 and A. culbertsoni, and 9.9% between Acanthamoebn sp. YM-4 and A. polyphcga.

Accnthamoebn sp. W-4는 영양형 및 포낭의 형태학적 특징이 A. culbefson가 비슷하지만. 마우스에 대한 병원성. in vitro 세포독성. isoenzyme pattern 비교 분석 및 콩-특이성 난세포군 항체 교차반응 등에 의하변 A. culbensoni와는 조금 다르다. 많은 아메바들이 다양한 환경에서 다양한 형태로 분리됨으로써 종 농정에 있어서 좀더 다양한 정보를 얻고자 분자유전학적 접근을 시도하였다 본 실험은 Acanthcmoebc sp. YM-4(한국 분리수)에 대한 미토콘드리아 DNA(mtDNA)를 분리하여. 여러 종의 제한효소를 처리함으로써 mtDNA의 단편들을 얻은 다 전체 크기 및 제한효소 절단 단편길이 다형성(RFLP) 분석을 하였다. 5가지의 제한효소 즉 Hce III. Hind III . Cla I. pvu II 빛 Sal I으로 처리된 Acanthamoebn의 mtDNA는 최소 3개의 단편들고부터 많은 것은 15개의 단편들로까지 나뉘어졌다. 단편들을 합산한 mtDNA의 전체 크기는 Acnnthcmoebc sp. YM-4가 평균 46.4 kbp였으며 A. culbertsoni 및 A. potwphcgc는 각각 48.3 kbp 및 48.8 kbp로 관찰되었다 제한효소 단편길이들은 0. 6 kip초부터 34. 4 kbp가시 다양하였으며. Accnthcmoebc sp. YM- 4의 mtDNA 단편들을 A. culbertsorli 및 A. polyphnbc와 비교해 볼 때 각각 총 67개 및 65개 중에서 총통으로 갖은 단편들이 각각 9개 및 7개로 관찰되었다. 그것을 토대로 genetic divergence를 계산한 결과 Accnthnmoebn sp. YM-4차 A. culbertsoni 간에는 10.1%였으며 A. poIWphogc와는 0.99%였다. 이런 다형성의 결과는 Acnnthcmoebc sp. YM-4가 A. culbertsoni 및 A. poIMphafc와는 종이 다를 수 있다는 것을 보여준다고 하겠다.

Keywords