Restriction Fragment Length Polymorphism of Mycobacterium Tuberculosis in a University Hospital in Seoul

서울의 한 대학병원에서 동정된 결핵균 균주의 RFLP 양상

  • Kim, Woo-Jin (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Yim, Jae-Joon (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Lee, Jae-Ho (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Yoo, Chul-Gyu (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Chung, Hee-Soon (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Han, Sung-Koo (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Shim, Young-Soo (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine) ;
  • Kim, Young-Whan (Department of Internal Medicine and Lung Institute, Seoul National University College of Medicine)
  • 김우진 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 임재준 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 이재호 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 이춘택 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 정희순 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 한성구 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 심영수 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소) ;
  • 김영환 (서울대학교 의과대학 내과학교실 및 의학연구원 폐연구소)
  • Published : 2000.03.30

Abstract

Background : DNA fingerprinting of Mycobacterium tuberculosis with RFLP is a very useful tool for deciphering the molecular epidemiology of tuberculosis. An international comparison of the RFLP pattern became possible with the proposal to standardize RFLP methodology using Pvu-II restricted IS-6110, and the comparison has noted some predominance of RFLP pattern in East Asia. The RFLP patterns of tuberculosis strains collected at SNUH was studied and was compared with other strains from East Asia. Method : Fifty strains of M. tuberculosis were isolated from patients who visited 'or were admitted to the SNUH in 1998. Some isolates belonging to the Beijing family were also received. After the extraction of DNA from M. tuberculosis isolates, the chromosomal DNAs were digested with Pvu-II and analyzed by the Southern blot method with DNA probe to IS6110. Result : Six strains belonged to the Beijing family. The RFLP patterns of other 9 strains were similar to each other. No statistically significant endobronchial tuberculosis, presence of underlying disease. and the province of residence were found. Conclusion : Few groups of M. tuberculosis strains from SNUH showed similar RFLP patterns, but their clinical implications are not yet clear.

연구배경 : RFLP를 이용한 결핵균의 유전자 분석은 결핵의 분자 역학적 연구에 유용하게 이용되고 있다. Pvu-II 효소를 이용한 RFLP 방법의 표준화로 RFLP 양상의 국제적인 비교가 가능해졌고, 극동아시아에서 RFLP 양상이 유사한 결핵균주의 군이 발견되었다. 저자들은 서울대병원에서 수집된 결핵균의 RFLP 양상을 분석하고 다른 극동아시아의 균주들과 비교하였다. 방 법 : 1998년 서울대병원에 입원했거나 외래 방문한 환자의 객담에서 분리하여 배양된 50개의 결핵균주를 대상으로 하였다. 결핵균주에서 DNA를 추출한 뒤, Pvu-II로 소화시키고, IS6110에 대한 DNA probe를 이용하여 Southern blot을 시행하였다. 이들의 RFLP 양상을 비교하여 유사성이 있는 균주들을 같은 군으로 분류하였고, RFLP의 다양성의 정도와 각 군 간의 임상적인 차이가 있는지 알아보고자 하였다. 결 과 : 50개의 결핵균 균주 중에서 6예의 Beijing family를 확인하였고, 다른 9개의 균주가 한 군으로 분류되었다. 이들 균주 군간에 나이, 성별, 지역, 약제 내성, 기관지 결핵 동반 여부, 기저질환 유무 등의 임상상에서는 차이를 보이지 않았다. 결 론 : 서울대병원에서 분리된 결핵균주의 RFLP 양상에서 서로 유사한 군이 존재함을 확인할 수 있었다. 그러나, 이들이 임상적으로는 큰 의미를 갖지 못하는 것으로 보인다.

Keywords