인간 내생 레토르바이러스 HERV-S의 LTR엘리먼트의 동정과 계통분류

Identification and Phylogeny of Long Terminal Repeat Elements of Human Endogenous Retrovirus HERV-S

최근 새로운 인간 내생 레트로바이러스 패밀리(HERAV-S)가 인간의 X 염색체상에서 동정 되었다. 그 길이는 6.7kb 이며 LTR-gag-pol-env-LTR의 일반적인 레트로바이러스의 구조를 가졌다. PCR 방법과 염기서열분석을 통하여 인간 게놈 DNA에서 HERV-S LTR 패밀리를 동정하였다. 네 개의 LTR엘리먼트(HSL-1, HSL-5, HSL-10, HSL-11)가 동정 되었으며, 이들은 HERV-S LLR 패밀리는 영장류의 진화과정에서 진화적인 분기를 통해 주된 2개의 그룹으로 나뉘어졌다. 영장류에서 이러한 HERV-S LTR들의 연구가 이루어진다면 이들의 영장류 게놈 내의 삽입시기를 알 수 있고 또한 인류의 진화를 이해하는데 크게 이바지 할 것이다.

A new human endogenous retroviral family (HERV-S) has recently been identified from human X chromosome. It is 6.7 kb in length and has a typical retroviral structure with LTR-gag-pol-env-LTR. Using the PCR and sequencing approach, we investigated LTR elements of the HERV-S family from a human genomic DNA. Four LTR elements (HSL-1, HSL-5, HSL-10, HSL-11) were identified and have a high degree of sequence similarity(96-99%) with that of the HERV-S. Phylogenetic analysis from the HERV-S family indicated that the LTR elements were mainly divided into 2- groups through evolutionary divergence in the primate evolution. Further investigation of the HERV-S LTR elements in primates may cast light on the integration timing into the primate genome and understanding of human evolution.