Molecular Analysis of Bacterial Communities Distributed in Sea Water of Whitening Areas of Jeju Coast

제주연안 갯녹음(백화) 지역의 해수에 분포하는 세균군의 분자생물학적 분석

  • 강형일 (제주대학교 생명과학과, 제주대학교 기초과학연구소) ;
  • 강봉조 (제주도해양수산자원연구소) ;
  • 김미란 (제주대학교 생명과학과) ;
  • 윤병준 (제주대학교 생명과학과) ;
  • 이동헌 (제주대학교 생명과학과) ;
  • 오덕철 (주대학교 생명과학과, 제주대학교 기초과학연구소)
  • Published : 2002.06.01

Abstract

In this study, the bacterial communities distributed in sea water of the whitening areas of Gangjeong and Seongsan, Jeju-do have been analysed using the PCR amplification of 16S rRNA to obtain fundamental data and information on relationship of the whitening phenomenon and microbial ecosystem. In Gangjeong, diverse bacteria such as Alcanivorax, Paracoccus, Damselae, Pseudomonas, Rhodowlum, Silicibacter, Suiftobacter, and Roseobacter have been found, and Alcanivorax was the most abundant clone. The most abundant clone from Seongsan was Pseudomonas, of which Pseudomonas tolaasii and Pseudomonas mandeli were most abundantly occurred in the frequency of approx44% and 24%, respectively. Approx4% of the bacterial clones closest to Verrucomicrobiales and other unidentified clones were also fecund in Seongsan, suggesting there is a great discrepancy between bacterial communities from the whitening areas of Seongsan and Gangjeong. The mean temperature, chlorine concentration, pH, and dissolved oxygen (DO) of the sea water of Gangieong and Seongsan in August of 2001 (sampling period) was $27^{\circ}C$~$27.5^{\circ}C$, 30.24~30.60%, pH 8.23~8.36,7 .20~7.28 mg/ι, suggesting other environmental factors except far the factors mentioned above might result in difference of bacterial communities distributed in both areas.

본 연구에서는 갯녹음(백화)현상이 세균생태계와 어떤 관련 이 있는 지에 대한 기초자료 및 정보를 얻기 위하여 갯녹음 현상이 일어난 제주도 성산과 강정지역 연안의 해수에 존재하는 세균군을 16S rRNA중폭기법을 이용하여 조사하였다. 강정지 역에서는 Alcanivorax, Paracoccus, Damselae, Pseudomonas, Rhodovulum, Silicibacter, Sulfitobacter, Roseobacter등 다양한 종류의 세균이 분포되어 있었으며, Alcanivorax가 20%의 빈도로 가장 많이 나타났다. 반면, 성산 지역에서는 Pseudomonas속 균주가 우점종으로서 존재하였으며, Pseudomonas tolaasii (혹은 Pseudomonas corrugata)와 유연관계가 가까운 세균은 44%, Pseudamonas mandeli와 가까운 세균이 24%, Verrucomicrobiales와 가까운 세균은 4%,기타 동정되지 알은 세균은 세 group으로 구분되었으며, 각각 8%,8%, 12%를 차지하여, 두곳에 분포되어 있는 세균군상이 상당한 차이점 이 있음을 확인하였다. 갯녹음 지역인 강정과 성산 해수의 8월(표품 채집시기)의 수온은 $27^{\circ}C$~$27.4^{\circ}C$, 염분의 농도는 30.24-30.60%, pH는 8.23~8.36,용존산소량(DO)은 각각 7.20~7.28로, 두지역에서 매우 비슷한 것으로 조사된 바 있는 데, 이는 수온이나 염분의 농도, 또는 pH보다는 다른 원인에 의하여 두 갯녹음 지역에 분포하는 세균군의 차이를 가져왔음을 제시해 주었다.

Keywords

References

  1. 제주지역 23개 마을어장에 대한 잠수 표본조사 보고서 국립수산진흥원
  2. 해양환경공정시험방법 해양수산부
  3. 제주도 갯녹음(백화)현상의 발생요인과 복원 제주대학교 해양과학대학 BK21 사업단
  4. 한국천해 경성저질에서의 백화현상에 대한 연구 한국해양연구소
  5. Marine Microbiology Austin, B.
  6. Contemporary Microbial Ecology Mineralization and the bacterial cycling of carbon, nitrogen, and sulfur in marine sediments Jorgensen, B.B.;D.C. Ellwood(ed.);J.N. Hedger(ed.);M.J. Latham(ed.);J.M. Lynch(ed.);J.H. Slater(ed.)
  7. FEMS Microbiol. Lett. v.190 Characterization of strain HY99, a novel microorganism capable of aerobic and anaerobic degradation of aniline Kahng, H.-Y.;J.J. Kukor;K.-H. Oh. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2000.tb09289.x
  8. Appl. Environ. Microbiol. v.67 Genetic and functional analysis of the tbc operons for catabolism of alky1- and chloroaromatic compounds in Burkholderia sp. JS150 Kahng, H.-Y.;J.C. Mainverni;M.M. Majko;J.J. Kukor https://doi.org/10.1128/AEM.67.10.4805-4816.2001
  9. Molecular cloning-A laboratory manual Maniatis, T.;E.F. Fritsch;J. Sambrook
  10. NoAA Technical Report NMFS v.102 Marine afforestation of Eisenia bicyclis(Lamianariaceae: Phaeophyta) Taniguchi, T.
  11. Adv. Ecol. Res. v.17 El Nino effects on southern California kelp forest communities Tenger, M.J.;P.K. Dayton https://doi.org/10.1016/S0065-2504(08)60247-0
  12. Bot. Mag. Tokyo v.100 Productivity of the Ecklonia cava community in a bay of Izu peninsula on the Pacific coast of Japan Yokohama, Y.;J. Tanaka;M. Chihara https://doi.org/10.1007/BF02488318