Korean Journal of Microbiology (미생물학회지)

The Microbiological Society of Korea (한국미생물학회)
권호 표지

Subgrouping of Pseudomonas aeruginosa Isolates by Resemblance Coefficiency of the Cellular Fatty Acid Analysis

수환경 녹농균의 세포막 지방산 유사도 분석에 의한 Subgrouping과 활용

  • 정현미 (국립환경연구원 물환경연구부 수질미생물과) ;
  • 김동빈 (국립환경연구원 물환경연구부 수질미생물과)
  • Published : 2002.12.01
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Abstract

To find the applicability of resemblance of the fatty acid methy1 ester (FAME) profile analysis to the primary examination for the tracing P. aeruginosa contamination in the environment and water plants, we designed this study. Of6l P. aeruginosa isolates including 3 reference strains, 4 fecal or soil isolates and 54 water isolates, the resemblance coefficiencies of the FAMEs were calculated as euclidian distance (ED) and expressed as dendrogram. The 61 strains were clustered as the same group in the ED 8.4, and divided into 4 subgroups in the ED 6.9. The water isolates from Han River were classified into distinctively different subgroups from reference strains. These results provide the possibility of the dendrogram from FAME profile as a useful tools for tracing contamination as well as for identifying the species, especially in case of P. aeruginosa.

본 연구는 수환경이나 먹는샘물 생산 공장 등에서 녹농균이 검출되었을 경우 오염원추적의 1차 조사수단으로 세포막 지방산의 유사도 분석 활용 가능성을 평가함을 목적으로 하였다. 이를 위하여 54개 수환경 분리 균주, 3개 표준 균주, 토양과 분변 분리 균주 4종 등 총 61 개 녹농균의 세포 지방산을 분석하였고, 유사도를 산정하여 가계도식 도표(dendrogram)로 나타내었다. 그 결과 61개 균주 모두가 ED (Euclidian Distance) 8.4에서 단일한 cluster로 grouping되었고 ED 6.9에서 4개의 subgroups들로 분류되었다. 그 subgroups들은 현장 분리, 외국의 표준 균주 등 기원에 따라 각각의 subgroup으로 분류되어 미생물 동정에 사용되는 세포 지방산 분석의 유사도 산출이 먹는샘물 공장 등 수환경에서 경제적이고 간단한 오염원 조사의 1차 수단으로서 활용 될 가능성을 보여주었다.

Keywords

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