The Korean Journal of Mycology (한국균학회지)

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Phylogenetic Relationships of Mushroom Agrocybe spp. Based on rDNA-ITS Analysis

rDNA-ITS분석에 의한 볏짚버섯 (Agrocybe spp.) 수집균주의 계통분류학적 특성구분

  • Cheong, Jong-Chun (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration(RDA)) ;
  • Lee, Myung-Chul (National Agrobiodiversity Center, National Academy of Agricultural Science, RDA) ;
  • Jang, Kab-Yeul (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration(RDA)) ;
  • Jhune, Chang-Sung (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration(RDA)) ;
  • Lee, Chan-Jung (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration(RDA))
  • 정종천 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 이명철 (국립농업과학원 농업유전자원센터) ;
  • 장갑열 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 전창성 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 이찬중 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과)
  • Published : 2009.06.30
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Abstract

Phylogenetic relationships were investigated in the mushroom genus Agrocybe based on sequence data from the internal transcribed spaces(ITS) of nuclear ribosomal DNA(rDNA). Thirty strains including Agrocybe aegerita, A. grocybe cylindracea, A. grocybe praecox, A. grocybe pediades and Unknown Agrocybe species were subjected for the analysis. The Agrocybe spp. were separated into eight distinct groups. Phylogenetic analysis divided these species into eight groups as follows: A. chaxingu within group I, A. salicacola within group II, A. cylindracea and A. aegerita within group III, Agrocybe sp. within group IV and V, and other Agrocybe spp. were grouped within VI, VII, and VIII.

볏짚버섯속(Agrocybe sp.) 균의 분자생물학적 유연관계분석을 통한 종(species) 구분을 위하여 국립원예특작과학원 버섯과에 보존중인 ASI $19001{\sim}19032$중 30균주를 공시하고 rDNA의 ITS영역 염기서열을 비교하였다. 그 결과, ASI 19007, 19016, 19019, 19020, 19022, 19023, 19024, 19025, 19027, 19028, 19031, 19032 등 12균주가 A. chaxingu; ASI 19021, 19026 등 2균주가 A. salicacola; ASI 19002, 19003, 19004, 19005, 19029 등 5균주가 A. cylindracea; 19001, 19010, 19011, 19012, 19013, 19015등 6균주가 A. erebia; 그리고 ASI 19008; ASI 19017과 19018; ASI 19009; ASI 19014 등 8그룹으로 구분되었다. 이 결과는 기존의 톱밥병재배 시험에서 자실체가 발생한 18균주 중에서 버섯 발생이 잘 되었던 ASI 19003 등 5균주(A. cylindracea)와 ASI 19007 등 10균주(A. chaxingu), ASI 19026 등 2균주(A. salicacola)는 균의 배양속도, 자실체의 발생과 생육기간등 재배적 특성으로 그룹(Species 수준) 간에 구분이 뚜렷 하였는데, 이는 본 시험의 분지도에 나타난 A. chaxingu, A. cylindracea의 구분 결과와 일치하였다. 따라서 rDNA ITS 영역의 염기서열분석은 Agrocybe속 버섯의 종 구분에 있어서 선행적, 보충적 수단으로 활용하기에 충분하다고 판단된다. 또한 본 시험 등에서 조사한 볏짚버섯속 균주들의 특성과 종 구분을 통하여 육종 모본 선발 및 균의 특성에 맞는 재배관리와 소비자 기호에 알맞은 균주의 선택등이 가능할 것으로 기대된다.

Keywords

References

  1. 김한경, 박정식, 김양섭, 차동열, 박용환. 1988. 버들송이(A. aegerita) 균사생장 조건에 관한 연구. 농사시험연구논문집 30(3):41-50
  2. 김한경, 박정식, 김양섭, 차동열, 박용환. 1989. 소나무 톱밥을 이용한 버들송이 인공재배에 관한 연구. 한국균학회지 17(3):124-131
  3. 배신철. 1994. 버섯 및 도열병균의 분류를 위한 rDNA의 ITS와 IGR 부위의 PCR 분석. 경북대학교 대학원 박사학위논문.
  4. 석동권. 2006. 버들송이버섯의 생육특성 및 인공재배에 관한 연구. 2006 전국농업교사현장연구.
  5. 이지열. 원색한국버섯도감 p 137. 아카데미서적. 서울. 1988.
  6. 임업연구원. 1993. 버섯종균의 품종검정 및 종균심사규정. 임업연구원 훈령 제 113호(1993. 2. 4).
  7. 정종천, 이명철, 김범기, 박동석, 홍승범, 박정식. 2004. rDNA-ITS 분석에 의한 망태버섯속균(Dictyophora spp.)의 종간 구분 가능성. 한국균학회지 32(1): 1-7 https://doi.org/10.4489/KJM.2004.32.1.001
  8. 정종천, 석동권, 김승환, 전창성, 이찬중. 2008. 볏짚버섯속 ASI19003 (버들송이)과 ASI19016 (차신고)의 배양 및 재배적 특성. 한국버섯학회지 6(1):13-19
  9. 정종천, 석동권, 김승환, 전창성, 이찬중. 2009. 볏짚버섯속 보존 균주의 여름철 인공재배시 재배 및 형태적 특성. 한국버섯학회지 7(1):1-8
  10. 古川久彦. 1992. きのこ學: 158-181. 共立出版(株)
  11. 今關六也, 本鄕次雄. 原色日本菌類圖鑑(I). p 58. 保育社. 大阪. 1958
  12. 今關六也, 大吉雄, 本鄕次雄. 日本のきのこ. p 218. 山と溪谷社. 東京. 1997
  13. Cheong, J. C., Kim, G. P., Kim, H. K., Park, J. S., and Chung, B. K. 2000. Cultural characteristics of veiled lady mushroom, Dictyophora spp. Mycobiology 28:165-170.
  14. Cheong, J. C., Seok, D. K. Kim, S. H. Jhune, C. S. and Lee, C. J. 2007. Cultural characteristics of artificially cultivated genus Agrocybe. Proceedings of the 8th China-Korea Joint Symposium for Mycology (Mycological Society of China): 156
  15. Graham, G. C., Mayer, S. P. and Henry, R. J. 1994. Amplified method for the preparation of fungal genomic DNA for PCR and RAPD analysis. Biotechniques. 16:175-269
  16. Jukes, T. H. and Cantor, C. R. 1969. Evolution of protein molecules, p. 21-132. In H. N. Munro (ed.), Mammalian protein metabolism. Academy Press, New York, N. Y.
  17. Kumar, S., Tamura, K. and Nei, M. 1993. MEGA: molecular evolutionary genetics analysis, Version 1.0. The Pennsylvania State University, University Park, PA.
  18. Park, D. S., Shin, H. S. and Seok, S. J. 2001. Phylogenetic realtionship in the genus Agrocybe based on ITS region. Molecular Genetics. NIAST.
  19. Royse, D. J. and Nicholson, M. S. 1993. Allozymes, ribosomal DNA and breeding in Lentinula. Rept. Tottori Mycol. Inst. 31:162-167
  20. Sanger, F., Nicklen, S. and Coulson, A. R. 1977. DNA sequencing with chain terminating inhibitors. Proc. Natl. Acad. Sci., USA. 74(12):5463-5467. https://doi.org/10.1073/pnas.74.12.5463
  21. Singer, R. 1949. The Agaricales in modern taxonomy. Lilloa 22:493
  22. White, T. J., Burns, T., Lee, S. and Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungi ribosomal RNA Genes for phylogenetics. In PCR protocols: A guide to methods and ampplications. Eds by Innis, M. A., Gelfand, D. H., Sninski, J. J. and White, T. J. Academic Press, San Diego, California. pp. 315-322