Journal of the Korea Society of Computer and Information (한국컴퓨터정보학회논문지)

Korean Society of Computer Information (한국컴퓨터정보학회)
권호 표지
DOI QR코드

DOI QR Code

A Study of Query Processing Model to applied Meta Rule in 4-Level Layer based on Hybrid Databases

하이브리드 데이터베이스 기반의 4단계 레이어 계층구조에서 메타규칙을 적용한 질의어 수행 모델에 관한 연구

  • 오염덕 (충주대학교 컴퓨터과학과)
  • Published : 2009.06.30
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

A biological data acquisition based on web has emerged as a powerful tool for allowing scientists to interactively view entries form different databases, and to navigate from one database to another molecular-biology database links. In this paper, the biological conceptual model is constructed hybrid biological data model to represent interesting entities in the data sources to applying navigation rule property for each biological data source based on four biological data integrating layers to control biological data. When some user's requests for application service are occurred, we can get the data from database and data source via web service. In this paper, we propose a query processing model and execution structure based on integrating data layers that can search information on biological data sources.

웹을 통한 생물 데이터 접근 방식은 많은 과학자들에게 대화식으로 서로 다른 형식의 생물 데이터베이스 내용을 검색할 뿐만 아니라, 한 데이터베이스에서 다른 분자생물 데이터베이스로의 연결을 위한 강력한 도구를 제공한다. 본 논문에서의 생물 개념 모델은 생물 데이터 제어를 위한 4가지 통합 레이어를 기반으로 각 생물 데이터 소스 간의 연관성에 따른 규칙 속성을 적용하고 데이터 소스 중에 관심 대상이 되는 개체를 표현하여 하이브리드 생물 데이터 모델을 구성하였다. 특정 사용자의 응용 서비스 요구가 발생하면 해당 생물 데이터베이스와 웹 서비스를 통한 데이터 소스로부터 정보를 획득한다. 본 논문에서는 통합 레이어를 기반으로 웹 데이터 소스 상에서 정보를 탐색하기 위해 메타 규칙을 적용한 질의어 처리 모형과 수행구조를 정형화하였다.

Keywords

References

  1. Levy A., "Logic-based techniques in data integration", Logic Based Edited by Jack Minker, Kluwer Publishers, 2000.
  2. Caragea, D., Silvescu, A.. and Honavar, "Towards a Theoretical Framework for Analysis and Synthesis of Agents That Learn from Distributed Dynamic Data Sources", In: Emerging Neural Architectures Based on Neuroscience, Berlin: Springer-Verlag, pp. 547 - 559, 2001.
  3. Peter Mork, Ron Shaker, Alon Halevy, Peter Tarczy - Hornoch, "{PQL}: A declarative query language over dynamic biological data", Proceedings of the American Medical Informatics Association (AMIA) Anual Symposium, American Medical Informatics Association, San Antonio, Texas, pp. 533-537, 2002.
  4. Peter Mork, Alon Halevy, Peter Tarczy-Hornoch, "A Model for Data Integration Systems of Biomedical Data Applied to Online Genetic Databases", Symposium of the American Medical Informatics Association, pp. 473-477, 2001.
  5. M. Wilkinson, D. Gessler, A. Farmer, L. stein, "Bio MOBY2003 - Hooked on MOBY!", Virtual Conference on Genomics&Bioinformatics program, , 2003.
  6. Z. Wang, X. Gao, C. He, J.A. Miller, J.C. Kissinger, M. Heiges, C. Aurrecoechea, E.T. Kraemer and C. Pennington., "A Comparison of Federated Databases with Web Services for the Integration of Bioinformatics Data", In Press, Conference Proceedings: The 2007 World Congress in Computer Science, Computer Engineering, & Applied Computing, pp. 334-338, 2007.
  7. Michael Y. Galperin, "The Molecular Biology Data- base Collection: 2007 update": NUCLEIC ACIDS RES., 25, pp. D3-D4, 2007.
  8. Vladimir Zadorozhny, Louiqa Raschid, "Query Optimi -zation to Meet Performance Targets for Wide Area Applications", ICDCS, pp. 271-279, 2002.
  9. Hass L. M., "Discovery Link: A System for integrated access to life sciences data sources", IBM System Journal, Vol. 40, No 2, pp. 489-511, 2001. https://doi.org/10.1147/sj.402.0489
  10. Reinoso J., Silvescu, A., Caragea, D., Pathak. J., and Honavar, V. "A Federated Query-Centric Approach to Information Extraction and Integration from Heterogeneous, Distributed and Autonomous Data Sources", In: Proceedings of the 2003 IEEE International Conference on Information Reuse and Integration(IRI 2003), October 27-29, Las Vegas, NV. USA. pp. 183-191, 2003.
  11. Davidson, S.B., et al., "K2/Kleisli and GUS: Experiments in integrated access to genomic data sources"; IBM. Systems J. Vol. 40, pp. 512 - 531, 2001. https://doi.org/10.1147/sj.402.0512
  12. Reinoso-Castillo J., "Ontology-driven information extraction and integration from heterogeneous distributed autonomous data sources: A federated query centric approach", Masters Thesis, Iowa StateUniversity, 2002.
  13. Oh R. D, "NAMO : A Navigation Model on the Abstraction layer for Heterogeneous Biological Databases", The 4th Asia Pacific International Symposium on Information Technology, Goldcoast, Australia, Jan., Vol. 1, pp. 26-27, 2005.
  14. Oh R. D, "Semantic Navigaion Model and Query Processing in Multi-Bio Layer based on Federated Biological Databases", The 2nd Asia Pacific International Conference on Information Science and Technology(APICIST2007), Hanoi, Vietnam,, Dec. 13-14, pp. 1-7, 2007.
  15. 신진섭, 안우영, 오일용, "생체정보측정을 통한 진단시스템 개발", 한국컴퓨터정보학회논문지, 제 13권, 제 1호, 219-226쪽, 2008년 1월
  16. 이승근, 김영민, "계층적 상황 온톨로지 관리를 이용한 상황 인식 서비스 미들웨어 설계", 한국컴퓨터정보학회논문지, 제 11권, 제 1호, 185-194쪽, 2006년 3월