Journal of Mushroom (한국버섯학회지)

The Korean Society of Mushroom Science (한국버섯학회)
권호 표지

Phylogenetic relationships of medicinal mushroom Sparassis crispa strains using the rDNA-ITS and CAPS analysis

rDNA-ITS 및 CAPS 분석에 의한 꽃송이버섯 (Sparassis crispa) 수집균주의 계통분류학적 특성구분

  • Cheong, Jong-Chun (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration) ;
  • Lee, Myung-Chul (National Agrobiodiversity Center, National Academy of Agricultural Science, RDA) ;
  • Jhune, Chang-Sung (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration) ;
  • Lee, Chan-Jung (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration) ;
  • Shin, Pyeong-Gyun (Mushroom Research Division, National Institute of Horticultural & Herbal Science, Rural Development Administration)
  • 정종천 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 이명철 (국립농업과학원 농업유전자원센터) ;
  • 전창성 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 이찬중 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과) ;
  • 신평균 (농촌진흥청 국립원예특작과학원 버섯과)
  • Received : 2010.02.18
  • Accepted : 2010.03.08
  • Published : 2010.03.31
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Abstract

This study was carried out to analyze the genetic relationships among 22 strains of Sparassis crispa, which were collected from various regions of worldwide. The cleaved amplified polymorphic sequence were obtained from the ribosomal DNA ITS regions of each strain. Based on the sequence analysis, the presence of five different groups were observed. Most strains shared the high nucleotide sequence similarity (about 90%) to each other, except only one strain, KACC50866. Nucleotide sequence similarity of KACC50866 was below 10% to other strains, indicating the genetic relatedness of strain KACC50866 was low compared to other strains. More works such as mitochondria genome analysis should help to determine the precise genetic diversity of S. crispa strains.

본 시험은 국내외에서 수집한 꽃송이버섯균 22균주에 대하여 분자생물학적 유연관계를 분석하고자 하였다. 수집균주의 ribosomal DNA의 ITS 영역에 대한 cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) 분석 결과, KACC50866은 다른 균주들과 20%이하의 유연관계를 나타내었으며 나머지 균주들은 90% 이상의 유연관계를 보이면서 4그룹으로 구분되었다. 따라서 이들의 세분화된 분자생물학적 구분을 위하여 rDNA ITS 영역의 염기서열분석을 하여 구분하여 본 결과 KACC50866 균주는 다른 꽃송이버섯균과 유연관계가 매우 낮은 것으로 나타났다. 그리고 나머지 21개 균주는 같은 그룹으로 구분되어 있어 같은 종으로 생각할 수 있으나, 이들을 좀더 세분하기 위해서는 미토콘드리아의 유전자 서열 분석 등이 병행되어야 할 것으로 판단된다.

Keywords