• 제목/요약/키워드: ARF

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Dynamics of ARF regulation that control senescence and cancer

  • Ko, Aram;Han, Su Yeon;Song, Jaewhan
    • BMB Reports
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    • 제49권11호
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    • pp.598-606
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    • 2016
  • ARF is an alternative reading frame product of the INK4a/ARF locus, inactivated in numerous human cancers. ARF is a key regulator of cellular senescence, an irreversible cell growth arrest that suppresses tumor cell growth. It functions by sequestering MDM2 (a p53 E3 ligase) in the nucleolus, thus activating p53. Besides MDM2, ARF has numerous other interacting partners that induce either cellular senescence or apoptosis in a p53-independent manner. This further complicates the dynamics of the ARF network. Expression of ARF is frequently disrupted in human cancers, mainly due to epigenetic and transcriptional regulation. Vigorous studies on various transcription factors that either positively or negatively regulate ARF transcription have been carried out. However, recent focus on posttranslational modifications, particularly ubiquitination, indicates wider dynamic controls of ARF than previously known. In this review, we discuss the role and dynamic regulation of ARF in senescence and cancer.

Phospholipase D in Guinea Pig Lung Tissue Membrane is Regulated by Cytosolic ARF Proteins

  • Chung, Yean-Jun;Jeong, Jin-Rak;Lee, Byung-Chul;Kim, Ji-Young;Park, Young-In;Ro, Jai-Youl
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권6호
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    • pp.897-905
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    • 2003
  • Phospholipase D (PLD) and ADP-ribosylation factor (ARF) were partially purified on a series of column chromatography, and their biochemical properties were characterized to understand the regulatory mechanism of PLD activation by ARF protein in the antigen-induced immune responses in guinea pigs. Heparin Sepharose and high-Q Sepharose column chromatographies were used for the purification of PLD, and Sephadex G-25, DEAE Sephacel, Source 15 PHE (HIC), Superdex-75, and Uno-Q column chromatographies were used for the purification of ARF. The purified PLD and ARF proteins were identified with anti-rabbit PLD- or ARF-specific antibodies, showing about 64 or 85 kDa for the molecular mass of PLD and 29 or 35 kDa for the sizes of ARF. Partial cDNA of ARF3 was cloned by RT-PCR in guinea pig lung tissue and its nucleotides and amino acids were sequenced. Guinea pig ARF3 showed 92% of nucleotides sequence identity and 100% of amino acid sequence homology with human ARF3. The ARF-regulated PLD activity was measured in the oleate or ARFs-containing mixed lipid vesicles. The purified and recombinant ARF (rARF) activities were assessed with the $GTP{\gamma}S$ binding assay. The PLD activity was induced by oleate in a dose-dependent manner. The purified ARF and recombinant ARF3 increased PLD activity in guinea pig lung tissues. These data show that the activity of membrane-bound PLD can be regulated by the cytosolic ARF proteins, suggesting that ARF proteins in guinea pig lung can act as a regulatory factor in controlling the PLD activity in allergic reaction.

Regulatory Network of ARF in Cancer Development

  • Ko, Aram;Han, Su Yeon;Song, Jaewhan
    • Molecules and Cells
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    • 제41권5호
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    • pp.381-389
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    • 2018
  • ARF is a tumor suppressor protein that has a pivotal role in the prevention of cancer development through regulating cell proliferation, senescence, and apoptosis. As a factor that induces senescence, the role of ARF as a tumor suppressor is closely linked to the p53-MDM2 axis, which is a key process that restrains tumor formation. Thus, many cancer cells either lack a functional ARF or p53, which enables them to evade cell oncogenic stress-mediated cycle arrest, senescence, or apoptosis. In particular, the ARF gene is a frequent target of genetic and epigenetic alterations including promoter hyper-methylation or gene deletion. However, as many cancer cells still express ARF, pathways that negatively modulate transcriptional or post-translational regulation of ARF could be potentially important means for cancer cells to induce cellular proliferation. These recent findings of regulators affecting ARF protein stability along with its low levels in numerous human cancers indicate the significance of an ARF post-translational mechanism in cancers. Novel findings of regulators stimulating or suppressing ARF function would provide new therapeutic targets to manage cancer- and senescence-related diseases. In this review, we present the current knowledge on the regulation and alterations of ARF expression in human cancers, and indicate the importance of regulators of ARF as a prognostic marker and in potential therapeutic strategies.

강우 사상의 시·공간적 규모 특성을 반영한 호우중심형 ARF 산정 (Estimation of Storm-centered ARF in the Context of Temporal and Spatial Scale Characteristics of Storm Events)

  • 김은지;강부식
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2018년도 학술발표회
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    • pp.181-181
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    • 2018
  • 설계홍수량 산정 시 지점확률강우량을 대상유역 내 면적강우량으로 환산하기 위하여 면적우량 환산계수(areal reduction factor, ARF)를 적용한다. ARF 산정방법은 크게 면적고정형 방법과 호우중심형 방법으로 나뉜다. 면적고정형 방법은 현재 국내 하천설계기준에서 설계강우량 산정 시 활용하고 있는 방법이지만, 동 시간에 발생한 강우사상을 활용하지 않고 지점강우량과 면적강우량의 독립적인 빈도해석을 통해 산정되므로 비현실적인 값이라고 볼 수 있다. 본 연구에서는 강우사상의 공간분포 특성을 효과적으로 반영할 수 있는 레이더 강우 자료를 활용하여 한강권역의 호우중심형 ARF를 활용하였다. 호우중심형 ARF는 지속기간 1, 3, 6, 12, 24시간에 대하여 산정하였으며, 재현기간은 강우 사상의 규모에 따라 총 다섯 구간(0-10, 10-20, 20-50, 50-80, 80-100년)으로 분류하였다. 지속기간 및 재현기간에 따른 호우중심형 ARF는 강우 사상마다 산정되므로 다양한 값이 산재(scattered)되어 있는데, 대푯값을 선정하기 위하여 Weibull 분포의 비초과확률 95%의 값을 추출하였다. 두 가지 방법으로 산정된 ARF는 지속기간에 대하여 로그형태로 증가하였으나, 재현기간에 따른 관계에서는 차이를 보였다. 면적고정형 ARF는 재현기간에 대한 민감도가 매우 낮았으나, 호우중심형 ARF는 재현기간에 따라 감소하였다. 또한 호우중심형 ARF는 지속시간이 길수록 재현기간에 대한 민감도가 점차 낮아졌으며 지속기간 24시간 이후로는 일정한 값을 보였다. 이러한 차이는 레이더 실 강우를 활용한 호우중심형 ARF 산정 시에 면적고정형 ARF 산정과정에서 고려되지 않는 강우의 시 공간적 특성을 반영하기 때문인 것으로 사료된다. 따라서 설계홍수량 산정 시 호우중심형 ARF를 적용한다면 보다 현실적인 값을 제시할 수 있을 것으로 판단된다.

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호우 형태에 따른 호우중심형 면적감소계수 비교 (Comparative Study of the Storm Centered Areal Reduction Factors by Storm Types)

  • 이동주;현석훈;강부식
    • 대한토목학회논문집
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    • 제35권6호
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    • pp.1219-1228
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    • 2015
  • 면적고정형 ARF (Fixed Area ARFs)방법은 강우관측소의 지점강우를 활용하여 산정되고 있으며, 공간적 관측밀도의 제약이 정확한 ARF산정에 제약조건이 되고 있다. 본 연구에서는 레이더 강우관측을 활용하여 호우중심형의 ARF를 제시하고자 한다. 호우중심형 ARF (Storm-centered ARFs)산정 시 강우의 이동성, 방향성, 공간분포를 고려하기 위하여 강우사상별 강우형상에 따른 타원 장축의 방향성 결정, 강우형상에 따른 면적별 최적면적강우량을 산정하여 ARF를 제시하였다. 전선형에 비하여 태풍의 ARF값의 변동 폭이 작은 것을 알 수 있었고, 전선형은 지속시간에 따라 ARF가 증가하지만, 태풍의 경우에는 오히려 ARF가 감소하는 모습을 볼 수 있었다. 이 결과 지속시간이 비교적 짧은 1~3시간에서는 태풍 산바 사상의 ARF가 크게 산정되었으나, 지속시간이 긴 6~24시간에서는 ARF가 전선형 강우에 비해 작게 산정됨을 확인하였다.

레이더 및 지상 합성강우장에 대한 지속시간-재현기간별 호우중심형 ARF (Storm-Centered Areal Reduction Factors by Durations and Return Periods Using Rain Fields with Composite of Radar and Gauge Rainfall)

  • 김은지;현석훈;강부식
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2016년도 학술발표회
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    • pp.285-285
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    • 2016
  • 설계홍수량 산정 시, 지점강우량을 대상 유역 내 면적강우량으로 환산하기 위해 면적우량환산계수(ARF, Areal Reduction Factors)를 적용한다. ARF를 산정하는 방법은 크게 면적고정형법(Fixed-Area Method)과 호우중심형법(Storm-Centered Method)로 나뉜다. 면적고정형법은 현재 국내 하천설계기준에서 활용하고 있는 방법이지만, 공간적 관측밀도의 제약으로 정확한 ARF 산정에는 한계가 있다. 또한 연 최대치계열의 독립적인 빈도해석을 통해 지점강우량과 면적강우량을 산정하므로 동시간(Synchronized)에 발생하는 강우 사상이라고 볼 수 없기 때문에 산정된 ARF는 실제 강우사상으로부터 산정된 값과 편차를 보인다. 반면 호우중심형법은 각각의 강우사상을 분석 대상 유역 중심에 공간전이 시켜 최대 강우량이 발생하도록 하는 방법으로, 레이더 강우 자료를 활용하면 현실적 ARF값의 산정이 가능해진다. 레이더 강우는 기상청에서 제공하는 2007-2012년 홍수기(6-9월)의 10분 단위 단일편파 전국합성 레이더 자료를 활용하였으며, 대상지역으로는 한강 권역을 선정하였다. 그러나 기상청 레이더강우 자료의 경우 가용기간이 아직까지 충분하지 않아 다양한 빈도의 강우사상을 확보하는데 한계가 있어, 보조적으로 한강 권역의 지상강우 관측 자료를 수집하여 높은 재현기간의 강우사상이 부족한 문제점을 해결하고자 하였다. 산정된 레이더 및 지상강우 호우중심형 ARF는 통계적 분석을 통해 비초과확률 90%, 95%의 값을 추출하였으며, 지속시간 1시간, 3시간, 6시간, 12시간, 24시간과 재현기간 0~10년, 10~20년, 20~50년, 50~80년, 80~100년에 대한 호우중심형 ARF 회귀상수를 제시하였다. 비초과확률 95%에서 기존 국토해양부(2011)에서 제시된 ARF와 호우중심형 ARF는 대체로 유사한 경향을 보이고 있었으나, 지속시간이 비교적 긴 12시간, 24시간에서는 호우중심형이 기존 ARF보다 다소 작게 산정되는 패턴을 보이고 있어 설계적용 시 유의해야 할 것으로 사료된다.

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남강댐 유역의 면적우량 감소계수 산정 (Estimation of Areal Reduction Factor in Nam River Watershed)

  • 이진호;안경모;함계운;윤석민;이태삼
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2011년도 학술발표회
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    • pp.307-307
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    • 2011
  • ARF(Areal Reduction Factor, 면적우량감소계수)는 지점강우량을 면적 평균 강우량으로 변환하는 환산계수로 정의되며, 유역의 지형학적 특성과 강우의 공간적 분포특성을 반영한 유역단위의 ARF의 개발이 요구된다. 하지만 국내의 ARF는 대부분 한강유역을 대상으로 하고 있어 한강유역과 지형학적, 수문 기상학적 특징이 상이한 유역에 대하여 연구 결과를 적용하기는 많은 제약이 따를 것으로 판단된다. 따라서 본 연구에서는 남강댐 유역의 ARF를 산정하기 위해 7개의 강우관측소(산청, 삼가, 신안, 안의, 운봉, 태수, 함양)로부터 시강우자료(1990년~2010년)를 수집한 후 14개의 재현기간, 6개의 지속시간에 대한 지수형 ARF 회귀식을 산정하였다. 그 결과 남강댐 유역의 지수형 ARF 회귀식의 결정계수는 0.80~0.99로 높은 상관성을 나타내었다. 그리고 남강댐 유역의 ARF와 첨두홍수량의 관계를 분석하기 위해 남강댐 유역내의 산청유역을 대상으로 재현기간 100년, 지속시간 24시간에 대한 홍수량을 모의하였다. 그 결과 ARF의 적용 전 후의 첨두홍수량은 10% 이상 감소하는 것으로 나타났다. 따라서 남강댐 유역의 기상학적 특성을 고려한 첨두홍수량 산정을 위해서는 본 연구에서 제안한 ARF 회귀식이 유용할 것으로 판단된다.

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지속시간 및 재현기간에 따른 레이더 강우 호우중심형 ARF의 산정 (Estimation of Storm-centered Areal Reduction Factors by Durations and Return Periods Using Radar Rainfall)

  • 김은지;강부식
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2017년도 학술발표회
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    • pp.163-163
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    • 2017
  • 설계홍수량은 수공구조물의 규모를 결정하는데 이용되며, 국내에서는 설계홍수량을 산정하기 위하여 지속시간과 재현기간에 따라 면적강우량을 추정한다. 지점강우량은 제한된 지역을 대표하는 값이므로 지점강우량을 기준면적에 대한 면적강우량으로 환산하기 위하여 면적우량환산계수(ARF, Areal Reduction Factor)를 적용한다. ARF를 산정하는 방법은 과거 관측자료를 활용하여 산정하는 경험적 방법(empirical method)이 주를 이루고 있으며, 경험적 방법은 크게 면적고정형(Fixedarea) 방법과 호우중심형(Storm-centered) 방법으로 분류된다. 면적고정형 방법은 국내 하천설계 기준에서 적용하고 있는 방법으로 면적강우 및 지점강우의 연 최대치를 독립적으로 빈도 해석하여 ARF를 산정하므로 실제 강우사상으로부터 산정된 값과 편차를 보인다. 반면 호우중심형 방법은 각각의 강우사상을 분석 대상 유역 중심에 공간 전이시켜 최대 강우량이 발생하도록 하는 방법으로, 레이더 강우를 활용하면 실제 강우사상의 공간분포 특성을 반영한 현실적인 ARF 산정이 가능하다. 본 연구에서는 국내 기상청에서 제공하는 홍수기(6-9월)의 10분 단위 단일편파 전국합성 레이더 자료를 활용하여 지속시간 1, 3, 6, 12, 24시간에 대한 호우중심형 ARF를 산정하였고, 면적강우 산정 시, 강우사상의 면적을 원형 또는 타원형으로 선정하여 강우의 형상 및 방향성을 고려하였다. 또한 레이더 강우의 중심강우를 지상강우 자료로 산정된 확률강우량 기준으로 분류하여 재현기간별 호우중심형 ARF를 산정하였으며, 이를 통해 기준면적, 지속시간, 재현기간에 따른 ARF의 특성을 분석하고자 하였다.

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TCP와 UDP 프로토콜 상에서 ARF 기법에 따른 무선랜 성능 분석 (Analysis of WLAN Performance Depending on ARF Scheme with TCP and UDP Protocols)

  • 김남기;이민;윤현수
    • 정보처리학회논문지C
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    • 제12C권3호
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    • pp.395-400
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    • 2005
  • IEEE 802.11b 무선랜은 다양한 전송률(transmission rate)을 지원하며 그 전송률은 자동 전송률 제어 알고리즘(auto rate control algorithm)에 의해 스스로 적응하여 변환된다. 따라서 자동 전송률 제어 알고리즘은 무선랜 전체 시스템 성능에 매우 큰 영향을 끼친다. 그러므로 본 논문에서는 자동 전송률 제어 알고리즘, 특히 ARF(Auto Rate Fallback) 방식의 자동 전송률 제어 알고리즘이 무선랜의 성능에 미치는 영향을 측정하고 그 결과를 분석해 본다. 분석 결과, ARF 방식의 자동 전송률 제어 알고리즘은 노드의 위치로 인한 신호 잡음에 효과적으로 잘 동작하는 모습을 보여 주었다. 하지만 ARF 방식은 여러 개의 노드가 무선채널을 얻기 위해 경쟁할 때, 신호의 충돌로 인한 패킷의 손실에 대해 적절히 대처하지 못해, 무선랜 전체 시스템 성능의 심각한 저하를 가져옴을 알 수 있었다. 그리고 TCP 프로토콜은 활성 노드 수의 증가를 제한해서 ARF에 의한 성능 저하를 막을 수 있다. 하지만 멀티미디어 데이터 전송과 같은 특정 응용프로그램은 TCP 프로토콜을 사용한다. 따라서 TCP 프로토콜은 모든 무선랜 응용프로그램을 위한 최적의 해결책이 될 수 없다.

Cloning and characterization of ADP-ribosylation factor 1b from the olive flounder Paralichthys olivaceus

  • Son, So-Hee;Jang, Jin-Hyeon;Jo, Hyeon-Kyeong;Chung, Joon-Ki;Lee, Hyung-Ho
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제20권6호
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    • pp.10.1-10.7
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    • 2017
  • Small GTPases are well known as one of the signal transduction factors of immune systems. The ADP-ribosylation factors (ARFs) can be classified into three groups based on the peptide sequence, protein molecular weight, gene structure, and phylogenetic analysis. ARF1 recruits coat proteins to the Golgi membranes when it is bound to GTP. The class I duplicated ARF gene was cloned and characterized from the olive flounder (Paralichthys olivaceus) for this study. PoARF1b contains the GTP-binding motif and the switch 1 and 2 regions. PoARF1b and PoARF1b mutants were transfected into a Hirame natural embryo cell to determine the distribution of its GDP/GTP-bound state; consequently, it was confirmed that PoARF1b associates with the Golgi body when it is in a GTP-binding form. The results of the qPCR-described PoARF1b were expressed for all of the P. olivaceus tissues. The authors plan to study the gene expression patterns of PoARF1b in terms of immunity challenges.