• 식물병연구
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• 제17권3호
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• pp.376-380
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• 2011

P. syringae pv. tomato는 토마토에서 bacterial speck병을 일으키는 종자전염 세균으로, 감수성 품종에서 주로 발병하여 경제적으로 큰 손실을 입힌다. 따라서 P. syringae pv. tomato는 한국을 비롯한 많은 나라에서 식물 검역대상 세균으로 지정하여 관리되고 있다. 본 연구에서 우리는 토마토 종자로부터 PCR을 이용하여 Pst를 검출할 수 있는 방법을 개발하였다. P. syringae pv. tomato의 hrpZ 유전자에서 특이적인 프라이머를 개발하였다. 개발된 프라이머는 P. syringae pv. tomato에서만 501 bp 크기의 특이적 DNA를 증폭하였으며, P. syringae pv. glycinea, P. syringae pv. maculicola, P. syringae pv. atropurpurea, P. syringae pv. morsprunorum와 같은 다른 토마토 세균병원균과 P. syringae pathovar 균주들에서는 증폭되지 않았다. Nested PCR 프라이머를 이용한 PCR에서도 오직 P. syringae pv. tomato에서만 119 bp 크기의 특이적 DNA가 증폭되었고, 토마토 종자에서 P. syringae pv. tomato을 정확하고 민감하게 검출하였다. 본 연구는 현재까지 사용되고 있는 Pst의 검출방법의 민감도를 비교한 최초의 보고로 본 연구에서 개발된 PCR방법들은 토마토 종자에서 Pst을 검출하는 매우 유용한 방법으로 생각된다.

• 식물병연구
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• 제7권3호
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• pp.123-133
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• 2001

Many pathovars of the species Pseudomonas syringae are known to produce different phytotoxins as secondary metabolites. Although phytotoxins generally enhance the virulence of P. syringae, they are not required for pathogenesis. Among the phytotoxins produced by P. syringae, lipodepsipeptides, coronatine, phaseolotoxin, and tabtoxin are the most well-known toxins which have been intensively studied for their structure, mode of action, biosynthesis, and regulation. A polymerase chain reaction (PCR) technique that amplifies a segment of the phytotoxin gene cluster using a primer set has been developed in recent years. This method offers the advantages of speed and sensitivity compared to the approaches based on physiological and biochemical methods. PCR detection of genes involved in the production of toxins could be exploited for early diagnosis of plant diseases caused by P. syringae pathovars.

• 한국식물병리학회지
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• 제11권1호
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• pp.61-65
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• 1995

Photosynthetic characteristics of soybean leaves infected with Pseudomonas syringae pv. glycinea were investigated for 8 days. The difference in photosynthesis rate between healthy and diseased soybean leaves decreased for 2 to 4 days after inoculation and then increased. In respiration rate, healthy and diseased leaves showed the same tendency as photosynthetic rate. The stomatal resistance increased following Pseudomonas syringae pv. glycinea infection. The total chlorophyll content of the infected leaf was less than that of the uninfected. Pseudomonas syringae pv. glycinea infection induced the malformation of stacked grana in chloroplast. Dry matter production declined after infection.

• 식물병연구
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• 제10권4호
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• pp.310-312
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• 2004

Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 참다래 궤양병을 일으키는 세균이다. 식물독소인 coronatine 생합성에 관여하는 유전자 중 하나인 cfl의 염기서열로부터 설계된 primer를 사용한 nested PCR 방법을 토양시료에 적용시켰다. 이 primer 세트와 우리나라에서 분리된 P. syringae pv. actinidiae가 접종된 토양으로부터 얻은 DNA로 두 번의 PCR을 행했을 때 665 bp와 310 bp의 절편이 각각 증폭되었다. 이 시스템을 참다래 궤양병으로 폐원된 과수원의 토양조사에 적용시킨 결과 여섯 곳으로부터 채취한 토양시료 모두에서 특이적인 310 bp의 PCR 산물이 증폭되었다.

• Journal of Microbiology
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• 제42권4호
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• pp.365-368
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• 2004

The occurrence of strA-strB streptomycin-resistance genes within transposon Tn5393 was examined in Pseudomonas syringae pv. actinidiae, P. syringae pv. syringae, and P. marginalis, isolated from kiwifruit plants in Korea and Japan. PCR amplification with primers specific to strA-strB revealed that three of the tested Pseudomonas species harbored these genes for a streptomycin-resistance determinant. Tn5393, containing strA-strB, was also identified with PCR primers designed to amplify parts of tnpA, res, and tnpR. No IS elements were detected within tnpR, nor were they found in the intergenic region between tnpR and strA. Nucleotide sequence analysis indicated that the strA sequence of P. syringae pv. actinidiae contained a single nucleotide alteration at position 593 (CAA $\rightarrow$CGA), as compared to Tn5393a in P. syringae pv. syringae. This resulted in an amino acid change, from Gin to Arg.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권1호
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• pp.110-118
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• 2003

Pseudomonas syringae pv. actinidiae strains, which cause canker disease in kiwifruit, were collected from kiwifruit orchards in Korea and identified using biochemical and physiological tests. The nucleotide sequences of the 16s rDNA and 16s-23s internally transcribed spacer of the isolates were found to be Identical to those of' the pathotype strain, Kwl 1, of P syringae pv. actinidiae. Remarkably, no coding sequence for phaseolotoxin biosynthesis or phaseolotoxin- resistant ornithine carbamoyltransferase was found by PCR amplification in any of the new Korean isolates of pseudomonas syringae pv. actinidiae, although this was clearly identified in the control pathotype Kwl 1 reference strain. In contrast, three primer sets derived from the coronatine biosynthetic gene cluster and DNA from the Korean strains yielded amplified DNA fragments of the expected size. A sequence analysis of the PCR products revealed that P. syringae pv. actinidiae and the Korean strains of pv. actinidiae contain coronafncate ligase genes (cfl)with identical sequences, whereas their. corR genes exhibited 91% sequence similarity. The production of coronatine, instead of phaseolotoxin, by the Korean strains of P. syringae pv. actinidiae was confirmed by a bioassay using reference pathovars known to produce coronatine and phaseolotoxin. The genes for coronatine biosynthesis in the Korean strains of P. syringae pv. actinidiae were found to be present on plasmids.

• 미생물학회지
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• 제55권1호
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• pp.80-82
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• 2019

Pseudomonas syringae pv. syringae WSPS007 균주는 대한민국 경상북도 영주시 사과 과원에서 나타난 가지마름병 병징으로부터 2013년 분리되었다. 본 논문에서는 6,238,498 bp(59.04% G+C 함량)인 WSPS007 균주의 전체 염기서열을 보고한다. 전체 지놈은 5,379개의 코딩서열, 65개의 tRNA, 16개의 rRNA 유전자를 가지고 있다. 특히 WSPS007 균주의 전체 염기서열 분석은 냉해와 관련된 빙핵 활성 유전자 클러스터를 중심으로 분석을 수행하였으며, P. syringae pv. syringae 국외 대표 균주인 PssB728a와 유사한 빙핵활성 유전자 구성을 가지고 있는 것으로 나타났다. 따라서 본 논문에서의 염기서열 분석 결과를 바탕으로 경상북도 일원 사과 과원에서 동해로 추정되는 병원균의 원인을 규명하기 위한 기본 자료를 제공하는데 있어서 의의가 있다고 사료된다.

• 미생물학회지
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• 제43권4호
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• pp.337-340
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• 2007

Pseudomonas syringae pv. syringae는 우리나라에서 참다래 꽃썩음병의 원인세균으로 알려져 있다. 본 연구에서는 우리나라의 서로 다른 참다래 과수원에서 분리되어 동정된 11개 균주의 꽃썩음병균이 가지고 있는 플라스미드 양상을 pulsed-field 젤 전기영동으로 조사하였다. 그 결과 전체 균주들은 가지고 있는 플라스미드의 개수와 크기에 따라 6개 그룹으로 나누어 졌다. 플라스미드의 수는 0에서 4개, 크기는 22 kb에서 160 kb로 다양하였다. 이들 중 두 개의 플라스미드를 가지고 있는 그를 III에 속하는 4균주가 Cu에 대한 저항성을 보였다. Southern blot hybridization 결과 Cu 저항성 유전자는 48 kb 크기의 플라스미드에 들어 있었다.

• 식물병연구
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• 제13권2호
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• pp.88-92
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• 2007

우리나라 참다래 과수원에서 참다래 꽃썩음병을 일으키는 원인 세균인 Pseudomonas syringae pv. syringae를 분리하였다. 총 41개 균주 중 스트렙토마이신 저항성을 보이는 2개의 균주를 대상으로 PCR과 염기서열 결정을 통해 저항성 유전자 구조를 조사하였다. PCR결과 스트렙토마이신 저항성유전자는 Tn5359a에 들어 있는 strA-strB 구조인 것으로 밝혀졌다. Xanthomonas campestris와 Erwinia amylovora에서 알려진 IS6100과 IS1133은 발견되지 않았다. strA-strB의 염기서열은 이미 밝혀진 Tn5393a와 동일하였다. 두 스트렙토마이신 저항성 균주는 각각 3개의 플라스미드를 가지고 있었으며 저항성 유전자는 그 중 100kb의 플라스미드에 들어 있었다.

• 식물병연구
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• 제27권4호
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• pp.180-186
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• 2021

경남과 전남의 육묘중인 수박과 정식한 포장의 유묘에서 황색의 둘레무리와수침상의 갈색 및 검은색의 반점의 병반이 관찰되었다. 병반에서 분리한 분리균은 수박과 쥬키니에서 높은 병원성을 보여주었다, 분리균은 4개의 속생모를 가진 막대형 세균이었다. 분리균은 그람음성으로 LOPAT group 1a에 속하였으며, King'B 배지에서 형광성이 없었다. 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용한 계통수 분석과 4개의 항존유전자 염기서열(gapA, gltA, gyrB, rpoD)을 이용한 multi-locus sequencing typing 분석 결과 분리균들은 Pseudomonas syringae pv. syringae와 가장 높은 상동성을 보여주었고, 같은 그룹(clade)으로 묶이었다. 또한 이들은 P. syringae genomospecies group 1에 속하였다. 수박의 잎점무늬병징에서 분리한 세균의 형태적, 생리적, 유전적 특징은 이들이 P. syringae pv. syringae임을 제시한다. 본 논문은 한국에서 P. syringae pv. syringae가 수박에서 점무늬병을 일으키는 최초의 보고이다.