• 제목/요약/키워드: PubMed

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PubMed 미러링 시스템, PubMedIF의 개발 (Implementation of PubMed Mirroring System, PubMedIF)

  • 이유진;차재혁
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2003년도 가을 학술발표논문집 Vol.30 No.2 (2)
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    • pp.841-843
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    • 2003
  • 본 논문은 PubMed를 통한 데이터 미러링 방법 및 시스템 개발에 대해 기술한다. 기존의 PubMed 데이터베이스 검색 시스템은 원격의 사용자와 network로 연결되었기 때문에 대역폭의 제한을 받으며, Web query interface를 이용하기 때문에 검색 방법이 제한적이다. 또한 Text mining과 같은 local application의 이용에는 효과적이지 못하다. 본 논문에서는 효과적인 미러링을 위한 검색어를 제안하고, network 연결 상황에서 발생할 수 있는 비정상적 종료를 극복할 수 있는 PubMedIF를 개발하였다.

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IntoPub: A Directory Server for Bioinformatics Tools and Databases

  • Jung, Dong-Soo;Kim, Ji-Han;Lee, Sang-Hyuk;Lee, Byung-Wook
    • Interdisciplinary Bio Central
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    • 제3권3호
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    • pp.12.1-12.3
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    • 2011
  • Bioinformatics tools and databases are useful for understanding and processing various biological data. Numerous resources are being published each year. It is not a trivial task to find up-to-date relevant tools and databases. Moreover, no server is available to provide comprehensive coverage on bioinformatics resources in all biological fields. Here, we present a directory server called IntoPub that provides information on web resources. First, we downloaded XML-formatted abstracts containing web URLs from the NCBI PubMed database by using 'ESearch-EFetch' function in the NCBI E-utilities. The information is obtained from abstracts in the PubMed by extracting 'www' or 'http' prefixes. Then, we cu-rate the downloaded abstracts both in automatic and manual fashion. As of July 2011, the IntoPub database has 12,118 abstracts containing web URLs from 174 journals. Our anal-ysis shows that the number of abstracts containing web resources has increased signifi-cantly every year. The server has been tested by many biologists from several countries to get opinion on user satisfaction, usefulness, practicability, and ease of use since January 2010. In the IntoPub web server, users can easily find relevant bioinformatics resources, as compared to searching in PubMed. IntoPub will continue to update and incorporate new web resources from PubMed and other literature databases. IntoPub, available at http://into.kobic.re.kr/, is updated every day.

의학 분야 Web DB의 품질평가 -PubMed와 Embase를 대상으로- (A Study on Quality Evaluation of Medical Web DBs : PubMed and Embase)

  • 김상준
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.161-187
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    • 2004
  • 본 연구는 의학 분야 Web DB의 품질평가를 위해 무료 PubMed와 상용 Embase DB를 선행연구 분석을 통해 품질평가 기준을 추출하여 객관적으로 측정하기 쉬운 평가항목을 중심으로 발견적ㆍ실무적 비교 평가를 실시한 것이다. 그 결과 PubMed는 최신성, 저널 형태의 논문 비중, 초록 보유 자료와 영어자료의 비중, 전자 저널 원문 링크 출판사 수, 자관 소장여부를 표시하는 LinkOut과 구입비용에서 우수하였다. 반면 Embase는 포괄성, 제약과 화학 분야, 수록정보의 다양한 형태에서 우수하였다. 따라서 상용 DB 도입의 타당성 검토와 이용자 교육 및 도서관 정보서비스는 이러한 두 DB의 품질평가 결과를 바탕으로 이루어져야 한다.

PubMed 메타데이터 수집기 및 동적 RSS 채널 생성기 개발 연구 (A Study on PubMed meta-data aggregator and dynamic RSS channel generator development)

  • 김선태;김재훈;한희준;현미환;이태석;예용희;여일연;윤희준
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2008년도 춘계 종합학술대회 논문집
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    • pp.832-835
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    • 2008
  • PubMed는 의학 분야의 독보적인 데이터베이스이다. 본 논문에서는 PubMed에서 제공하는 특정시점의 메타데이터 정보를 수집 구축하였으며, 이를 통해 웹2.0의 핵심 서비스인 RSS 채널을 동적으로 생성하는 서비스모델을 설계 구현한다. PubMed에서 제공하는 E-Utilities서비스(API)를 분석하였으며, 메타데이터 수집 구축기를 개발하였다. 또한 동적 RSS채널 생성기를 개발하였으며, RSS리더기를 이용한 활용방안을 제시하였다.

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PubMed와 상호 대차시스템의 연계방안 (A study on connecting system of the PubMed and interlibrary loan system)

  • 최홍식
    • 한국정보관리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보관리학회 2000년도 제7회 학술대회 논문집
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    • pp.165-168
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    • 2000
  • 본 연구는 현재 국내에서 별개로 운용되고 있는 PubMed와 원문을 입수하기 위한 상호대차시스템을 상호연계하는 방안을 모색하여, 신청과정의 번거로움을 해소하고, 편리하고 정확한 업무처리와 신속한 원문정보서비스가 이루어질 수 있는 현실적 방안을 제안하고자 한다.

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PubMed를 중심으로 비교한 국내 의학데이터베이스의 실태조사 및 분석 연구 (A Study on Domestic Medical Database with Comparison to PubMed)

  • 김현지;남서진
    • 한국정보관리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보관리학회 2018년도 제25회 학술대회 논문집
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    • pp.39-46
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    • 2018
  • 본 연구는 국외 의학데이터베이스인 PubMed를 중심으로 국내 의학데이터베이스인 KoreaMed와 KMBase의 특징 및 기능을 비교하고 개선방향을 도출해보고자 하였다. 이를 위해 선행연구를 토대로 비교 분석 기준을 추출하고 각 데이터베이스의 공식 홈페이지를 통해 그 특징들을 정리하였다, 그 결과 국내 의학데이터베이스는 공통적으로 콘텐츠 측면에서 시소러스와 저널선정기준을 개선하고, 검색기능 측면에서 상세 검색 필드, 관련 정보자원간의 링크, 검색결과의 정렬과 공유 기능을 보완할 필요가 있다는 것을 확인하였다.

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학술 웹 데이터베이스의 품질 비교 평가 : NDSL, P ubMed, Scopus와 Web of Science를 중심으로 (A Study on the Quality Evaluation of Scholarly Web Databases Focused on NDSL, PubMed, Scopus, and Web of Science)

  • 김상준
    • 정보관리연구
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    • 제36권3호
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    • pp.127-165
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    • 2005
  • NDSL과 PubMed와 같이 연구현장에서 무료로 서비스되는 DB가 있는 주제분야에 Scopus와 WoS DB와 같은 상용 DB를 도입하기 위한 검토과정에 DB의 품질평가를 위한 연구가 필요하다. 본 연구는 선행연구 분석을 통해 품질평가기준을 추출하여 짧은 시간에 객관적으로 측정하기 쉬운 평가항목을 중심으로 발견적 실무적 비교평가를 실시한 것이다. 그 결과 NDSL은 최신성과 저널 및 주제의 포괄성과 망라성에서 우수하며, PubMed는 최신성과 MeSH 색인에서 전통을 자랑하는 의학 및 생명과학 전문 DB인 반면, Scopus는 사회 및 자연과학 분야에서 현재 1996년 이후의 인용정보를 이용자 중심 인터페이스로 쉽게 이용할 수 있고, WoS는 인용색인을 탄생시킨 전통과 명성을 자랑하지만 구독료가 고가인 관계로 폭넓은 접근이 어렵다. 따라서 인용정보가 포함된 상용 Web DB 도입의 타당성 검토와 이용자교육 및 도서관정보 서비스는 이러한 Web DB의 품질평가 결과를 바탕으로 이루어져야 보다 효율적이고 생산적인 정보 서비스가 가능하다.

PubMed를 통해 살펴 본 알레르기 비염에 대한 보완 의학적 최신 연구 경향 (Study of Complementary Medical Therapy for Allergic Rhinitis in PubMed)

  • 정혜미;조민정;서운교
    • 대한한방내과학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.534-549
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    • 2009
  • Objectives : To study trends in complementary medical therapy for the allergic rhinitis. This study analyzed research on allergic rhinitis in PubMed. Methods : We searched PubMed related to complementary medical therapy for allergic rhinitis. We analyzed 25 research papers and examined published journals, years countries, and their methods, objectives, results, interventions, participants, periods and instruments of assessment. Results : The method of studies was mostly randomized, double-blind, placebo-controlled trial. There were research papers concerning treatment and prevention with herbal medicine, acupuncture, diet, etc. There were more positive results compared to negative results for treatment and prevention. Most studies were carried out during the winter/spring period. The median for number of participants was 90.54 persons. Diagnostic criteria for enrolment were nasal symptoms, allergic skin test, serum, nasal discharge allergen specific IgE eosinophil, etc. Assessment for outcomes were nasal symptoms, serum, nasal discharge allergen specific IgE eosinophil and Quality of Life Questionnaire. Conclusions : It is necessary to study effects of acupuncture and herb medicines for allergic rhinitis and more in-depth research about trends in complementary medical therapy for allergic rhinitis.

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PubMed에서 myofascial pain syndrome(MPS)과 acupuncture로 검색한 최근 연구 경향 (Systemic Review: The Study on myofascial pain syndrome(MPS) with acupuncture in PubMed)

  • 변임정;남상수;최도영
    • Journal of Acupuncture Research
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    • 제19권6호
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    • pp.171-183
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    • 2002
  • Objective : To research the trends of study related to myofascial pain syndrome(MPS) and acupuncture in PubMed, and to establish the hereafter direction of myofascial pain syndrome(MPS) with acupuncture. Methods : We searched in PubMed, with myofascial pain syndrome and acupuncture, trigger point and acupuncture limitted by abstract. Results : 1. The pattern of the study was as follows : Review article(11), Clinical(11) rondomized controlled trials(21). We further estimated 24 articles. 2. Many of these studies provide equivocal results because of designs, sample size and the other, affirmative view is 10 articles, contradictive view is 6 articles, and somewhat reservative regards are 8 articles for therapeutic effect of myofascial pain syndrome with acupuncture. 3. Suggestions on further endolphin related research, neurophysiology, biophysics and phamacology are made. 4. More clinical data would be needed to prove effects of myofascial pain syndrome with acupuncture.

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