• 제목/요약/키워드: Rice black-streaked dwarf virus

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Occurrence and Detection of Rice black-streaked dwarf virus in Korea

  • Lee, Bong-Choon;Hong, Yeon-Kyu;Hong, Sung-Jun;Park, Sung-Tae;Lee, Key-Woon
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권2호
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    • pp.172-173
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    • 2005
  • Until now, occurrence of Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) is observed in Gyeongsang provinces, southeastern part of Korea. However, recently, the occurrence of RBSDV is increasing and spreading in Jeonra provinces including Gochang-gun, southwestern part of Korea. RBSDV infected plants showed typical symptoms including stunted, deformed leaves with white waxy or black-streaked swelling along the veins. We extracted viral genomic dsRNA from infected leaves and analyzed dsRNA pattern by polyacrylamide gel electrophoresis. Ten genomic segments with similar sized dsRNAs were observed. We also detected RBSDV by reverse transcription (RT)-PCR using specific primers for S10 from genomic dsRNA and observed amplified DNA fragment specific for RBSDV S10.

The Complete Genome Sequence of Southern rice black-streaked dwarf virus Isolated from Vietnam

  • Dinh, Thi-Sau;Zhou, Cuiji;Cao, Xiuling;Han, Chenggui;Yu, Jialin;Li, Dawei;Zhang, Yongliang
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권4호
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    • pp.428-432
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    • 2012
  • We determined the complete genome sequence of a Vietnamese isolate of Southern rice black-streaked dwarf virus (SRBSDV). Whole genome comparisons and phylogenetic analysis showed that the genome of the Vietnamese isolate shared high nucleotide sequence identities of over 97.5% with those of the reported Chinese isolates, confirming a common origin of them. Moreover, the greatest divergence between different SRBSDV isolates was found in the segments S1, S3, S4 and S6, which differs from the sequence alignment results between SRBSDV and Rice black streaked dwarf virus (RBSDV), implying that SRBSDV evolved in a unique way independent of RBSDV. This is the first report of a complete nucleotide sequence of SRBSDV from Vietnam and our data provides new clues for further understanding of molecular variation and epidemiology of SRBSDV in Southeast Asia.

Molecular Diagnosis of Rice Black-Streaked Dwarf Virus in Japan and Korea

  • Masamichi Isogai;Ichiro Uyeda;Park, Jang-Kyung
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제17권3호
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    • pp.164-168
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    • 2001
  • Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) and Maize rough dwarf virus (MRDV) are closely related viruses. Since the two viruses produce identical symptoms on maize, barley, and wheat, diagnosis of infected plants is difficult. Previously, we reported that partial cDNA clones of RBSDV S5 and S6 from the Japanese isolate (RBSDV-H) have lower sequence homology to MRDV than do cDNA clones from other genomic segments. In order to test whether cDNA clones of RBSDV-H S5 and S6 can be used for molecular diagnosis, RBSDV field isolates from Korea and from Hokkaido, Japan were tested in dot blot hybridizations probed with RBSDV-H S5 and S6 cDNA colnes. Hybridization with these probes was more intense against the RBSDV genome than against the MRDV genome. Therefore, RBSDV-H S5 and S6 cDNA clones can be used to differentiate between the two viruses. Furthermore, RBSDV-H S5 and S6 clones reacted more strongly against the viruses from stunted maize plants from Korean fields than to MRDV, indicating that RBSDV may be the causal disease agent in maize plants in Korea.

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한국에서 벼 흑조위축병의 발생에 대하여 (Studies on the Occurrence of Rice Black-Streaked Dwarf Virus in Korea)

  • 이재열;이순형;정봉조
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.121-125
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    • 1977
  • 지금까지 우리나라에 발생되지 않았던 새로운 수도 바이러스병인 벼 흑조위축병에 대하여 실시한 확인 및 동정 실험결과는 다음과 같았다. 1) 애멸구(Laodelphax Striatellus FALLEN)가 벼 흑조위축병을 매개하였다. 2) 바이러스의 입자는 구형이었으며 직경은 약60nm이었다. 3) 이 병은 령, 호남지방 및 충청북도에서 발생하였다. 4) 이앙시기가 빠를수록, 바맥일수록 이병주율이 높았다.

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벼검은줄오갈병 바이러스가 매개충 및 기주식물에 미치는 영향 (The Effects of Rice Black-Streaked Dwarf Virus on Vector (Laodelphax striatellus U.) and Host Plants)

  • 이기운;김상규
    • 한국식물병리학회지
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    • 제1권3호
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    • pp.190-194
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    • 1985
  • 벼검은줄오갈병 매개충인 애멸구의 기주식물 선호성은 실내유균접종과 포장상태에서 공히 옥수수가 벼보다 낮으나 발병율은 아주 높았다. 바이러스가 매개충의 생태에 미치는 영향은 보독충이 무독충보다 성충의 생존일수, 부화약충수 및 성충율에서 심한 장애를 나타냈다. 벼에서는 감염초기부터 후기까지 건물중이 이병주가 건전주보다 낮았다. 그러나 옥수수에서는 감염초기에 이병주가 건전주보다 건물중이 높았다. 한천내확산법 및 미량심강법에 의한 감염바이러스의 정량결과, 항혈청과의 반응정도는 옥수수잎, 벼줄기, 벼잎, 옥수수줄기에서 부분순화한 항원바이러스의 순으로 나타났다. 이병기주식물의 phloem gall 형성에서 저온처리의 효과가 인정되었다.

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벼 흑조위축병 바이러스의 분자생물학적 연구 (A Molecular Study of Rice Black-Streaked Dwarf Virus)

  • 박종석;배신철;김영민;백융기;김주곤;황영수
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제37권3호
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    • pp.148-153
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    • 1994
  • 우리나라에서 발생하는 주요 벼 바이러스로써 저항성 유전자원이 없어 현재까지 저항성 품종이 육성되지 못하고 있는 흑조위축병(Rice Black-Streaked Dwarf Virus, RBSDV)에 대한 유전정보에 대하여 연구하였다. 매개충인 보독 애멸구를 이용하여 이병주를 생산한 후 바이러스 입자를 순수 분리하여 전기영동한 결과 10개의 band를 확인하였다. RBSDV RNA로부터 역전사 효소를 이용 cDNA를 합성한 후 ${\lambda}gt11$에 삽입하여 cDNA library를 만들었다. 이 library에서 6개의 단편을 선발하였으며 그중 한 개의 clone(pRV3)은 hybridization을 통해 RBSDV 게놈 조각 3번 유래인 것을 확인하였다. pRV3의 염기서열을 결정한 결과 2개의 ORF의 일부분들을 갖고 있었으며 이것은 바이러스 저항성 작물개발에 이용될 수 있을 것으로 생각된다.

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옥수수에 발생하는 벼검은줄오갈병의 유전자 비교 (Characterization of Rice black-streaked dwarf virus in Maize)

  • 이봉춘;윤영남;홍성준;홍연규;황재복;송석보;강항원;이기운
    • 식물병연구
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    • 제14권3호
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    • pp.223-225
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    • 2008
  • 2005년 전북 고참에서 채집한 옥수수 이병주로부터 벼검은줄오갈병 바이러스를 동정하였다. 이들 이병주로부터 게놈 dsRNA를 추출하여 polyacrylamide gel 전기영동으로 게놈 패턴을 분석 하였다. 전기영동 결과 이미 알려진 10개의 분절게놈을 확인하였으며 채집지역별 isolate에서 게놈 dsRNA이동도의 차이를 확인하였다. 추출된 dsRNA를 주형으로 하여 S10의 full-length 특이 primer를 사용하여 RT-PCR한 결과 1,801의 예상되는 band를 확인하여 RBSDV로 동정하였다. S10을 pGEM-T vector에 크로닝하여 염기서열 분석 결과 1,801nt, 559aa로 구성되어 있었다. 이는 벼에 발생하는 RBSDV S10의 크기와 동일하였으며 상동성 분석결과 18개 염기에서 변이가 확인되어 99%의 상동성을 나타내었다.

흑조위축병 바이러스 RNA를 절단하는 망치머리형 라이보자임의 제작 (Construction of a Hammerhead Ribozyme that Cleaves Rice Black-Streaked Dwarf Virus RNA)

  • 김주곤;손성한;이석순;황영수;박종석
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제38권6호
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    • pp.522-527
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    • 1995
  • 흑조위축병 바이러스(RBSDV)에 대한 antiviral agent를 개발하기위하여 RBSDV 게놈 조각 3번을 절단하는 망치머리형 구조의 라이보자임을 설계하였다. 라이보자임과 기질의 oligonucleotides는 DNA 합성기로 합성 후 서로 합치고, pBluescript KS(+)에 삽입하였다. 라이보자임과 기질 RNA는 $T_3$ RNA polymerase로 기내 전사하여 각각 193과 183 nucleotide의 RNA를 얻었다. 기질 RNA는 라이보자임 RNA에 의해 $55^{\circ}C$에서 2개의 조각으로 절단되었으나 $37^{\circ}C$에서는 절단되지 않았다. 또한 RBSDV의 3번 조각 RNA도 동일한 라이보자임에 의해 절단되었다. 이러한 결과로 합성된 헤머해드 라이보자임은 기내 절단 능력을 가지며 형질전환 식물체에서 antiviral agent로 이용될 수 있을 것이다.

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흑조위축병 다발지역에서 사일리지 옥수수 품종의 생산성 (Productivity of Silage Corn Hybrides in Rice Black-Streaked Dwarf Virus Prevalent Region)

  • 이석순;이진모
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제7권3호
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    • pp.140-145
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    • 1987
  • In 1985 and 1986, silage productivity of 8 Korean improved and 7 US introduced corn hybrids and their resistance to rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) were tested in the southern part of Korea where RBSDV is prevalent. The results obtained are summarized as followes: 1. Percentage of RBSDV diseased plantes differed depending on the year and hybrid. Suweon 19, Kwangok, Hoengseungok, Jecheonok, Pioneer 3424, Pioneer 3H001, NC6 13 1 were most susceptible, Pioneer 3 160 and Pioneer 3358 were moderately susceptible, and Nampyungok, Suweon 90, Pioneer XCF38, PB 2, and Jinjuok were least suceptible. No hybrid was completely resistant to RBSDV. 2. There were negative correlations between percentage of RBSDV diseased plants and culm length, percentage of ear bearing plants, ear yield, silage yield, or digestible dry matter, but percentage of RBSDV diseased plants was not correlated with stover yield. 3. Silage yield of Jinjuok, Pioneer 3160, Pioneer 3358, and Pioneer XCF38 were higher than that of other hybrids in both years. However, digestible dry matter of Nampyungok, Suweon 89, and Suweon 90 were higher than that of other hybrids due to a higher proportion of ear in 1986 when RBSDV infection was severer.

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