• 제목/요약/키워드: SeNPV-K1

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한국에서 분리된 파밤나방 핵다각체병 바이러스의 전체 유전체 분석 (Complete Genome Analysis of Spodoptera exigua Nucleopolyhedrovirus Isolated in Korea)

  • 최재방;김현수;우수동
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제61권3호
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    • pp.449-460
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    • 2022
  • 광식성 난방제 해충인 파밤나방(Spodoptera exigua)의 친환경적 방제원으로써 이용을 위해 국내에서 분리된 파밤나방 핵다각체병바이러스(S. exigua nucleopolyhedrovirus K1: SeNPV-K1)의 형태 및 전체 유전체 서열을 분석하였다. SeNPV-K1의 다각체(polyhedra)는 0.6-1.8 um 크기의 부정형으로, 기 보고된 SeNPV와 외형적 차이는 보이지 않았다. 전체 유전체의 염기서열을 분석한 결과, 기 보고된 SeNPV와 비교할 때 145 bp 더 많은 135,756 bp로 확인되었으며, G+C 함량은 44% 였고 상동반복영역은 6개로 두 바이러스간에 차이는 없었다. ORF 분석결과, SeNPV-K1은 기 보고된 것과 비교할 때 2개 더 적은 137개를 가지며, SeNPV-K1에만 존재하는 ORF는 4개가 확인되었다. 이들 4개의 ORF는 비필수 유전자로 바이러스의 특성에는 큰 영향을 주지 않을 것으로 여겨졌다. 유전체의 vista 분석 결과, SeNPV-K1과 기 보고된 SeNPV의 전체 염기서열 유사도가 매우 높은 것으로 확인되었다. 국내에서 처음으로 분석한 SeNPV-K1의 전체 유전체는 기 보고된 SeNPV와 유사한 것으로 나타났으나 서로 다른 분리주로 국내 고유자원임을 확인하였다.

Polyhedra Productions of Recombinant Autographa californica Nucle- opolyhedroyiruses Containing Additional Polyhedrin of Autographa Cali- fornica, Bombyx mori or Spodoptera exigua Nucleopolyhedrovirus

  • Chang, Jin-Hee;Roh, Jong-Yul;Jin, Byung-Rae;Je, Yeon-Ho
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제3권1호
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    • pp.13-18
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    • 2001
  • The role of polyhedrin in the polyhedra production in baculovirus Autograha californica Nucelopolyhedro-sisvirus (AcNPV) was studied by over-expression of AcNPV polyhedrin or heterologous polyhedrin from Bombyx mori (Bm) NPV or Spodoptera exigua (Se) NPV. The transfer vectors containing additional polyhedrin from AcNPV, BmNPV, or SeNPV were constructed and cotransfected with bacmid bApGOZA into Sf9 cells. The resulting recombinants, designated as vApAcPol, vApBmPol, and vApSePol were tonstructed, and the polyhedra production of the recombinant was characterized. All of the recombinants produced polyhedra in the nucleus, and the polyhedrin was over-expressed. Among three recombinants, vApAcPol and vApBmPol were discriminated by their larger polyhedra size than that of wild type AcNPV, and vApSePol also produced larger polyhedra than wild type SeNPV polyhedra.

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온도조건에 따른 파밤나방핵다각체병바이러스(SeNPV)의 병원 활성 (Effects of Different Temperatures on Pathogenicity of Spodoptera exigua Nucleopolyhedrovirus (SeNPV))

  • 김선곤;박종대;김도익;최형국;김상수;황인천
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.329-332
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    • 2004
  • 파밤나방 핵다각체병바이러스(Spodoptera exigua nucleopolyhedrovirus: SeNPV)의 온도별, 농도별로 병원활성을 조사한 결과는 다음과 같다. SeNPV의 온도에 따른 $LC_{50}$은 2령 $20^{\circ}C$에서는 $9.797{\times}10^{3}PIBs/mL$, $32^{\circ}C$에서는 $3.351{\times}10^{2}PIBs/mL$로 온도가 높아질수록 낮아졌으며, 다른 영기에서도 같은 경향이었다. $20^{\circ}C$에서 SeNPV $1.0{\times}10^{3}PIBs/mL$의 파밤나방 3령 유충에 대한 $LT_{50}$은 9.0일이었으나 SeNPV $1.0{\times}10^{4-6}PIBs/mL$에서는 6.9일-3.5일로 더 짧았다. 24, 28, $32^{\circ}C$의 SeNPV $1.0{\times}10^{4}PIBs/mL$에서는 5.7일, 5.5일, 4.9일의 병원 활성을 보여 온도가 올라갈수록 $LT_{50}$은 짧아졌다. 또한 바이러스 농도가 높고 유충의 영기가 어릴수록 짧아져 $LT_{50}$은 온도 바이러스 농도, 유충영기에 따라 차이가 있었다.

닭 전염성 기관지염 바이러스의 혈청 유병률 연구에서 개별혈청과 합병혈청의 비교 (Comparison of pooled Versus Individual Sera in Avian Infectious Bronchitis Virus Seroprevalence Study)

  • 김사림;권혁무;성환우;박선일
    • 한국임상수의학회지
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    • 제23권4권
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    • pp.416-420
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    • 2006
  • Compare to testing sera individually, pooled-serum testing has considered as a cost-effective method, particularly on a large population-based seroprevalence studies. This study was to determine the relationship between individual sera and pooled sera titers for detection of avian infectious bronchitis virus (IBV) and to evaluate suitability of pooled sera by comparing prevalences estimated from both samples. A total of 5,000 individual samples were collected from 500 flocks in Chungcheong, Gyunsgi, and Kangwon provinces between January 2005 and February 2006. Ten samples were randomly selected from each flock. Five-hundred pooled sera were prepared by mixing equal amount of each 10 individual serum from the original samples. IBV antibody titers were measured by hemagglutination inhibition (HI) test. The least squares regression analysis was performed to construct equation between pooled and mean individual titers. To determine whether the flock is infected 4 arbitrary criteria were used: detection of at least 1 chicken with HI titer ${\ge}$ 9 (criterion 1), detection of at least 2 samples with HI titer ${\ge}$9 (criterion 2), detection of at least 1 sample with HI titer ${\ge}$ 10 (criterion 3), and filially detection of at least 1 sample with HI titer ${\ge}$ 11 (criterion 4). The receiver operating characteristic (ROC) curve was used to examine the cut-off points of pooled titers showing optimal diagnostic accuracy. The area under the curve (AUC), sensitivities (Se), specificities (Sp), and positive (PPV) and negative (NPV) predictive values were calculated. The regression equation between pooled titers (pool) and mean individual titers (mean) was: $pool= 1.2498+0.8952{\times}mean$, with coefficient of determination of 87% (p< 0.0001). The optimal cut-off points of pooled titers were titer 8 for criterion 1 (AUC=0.975, Se=0.883, Sp=0.959, PPV=0.985, NPV=0.728), titer 8 for criterion 2 (AUC=0.969, Se=0.954, Sp=0.855, PPV=0.926, NPV=0.907), titer 9 for criterion 3 (AUC=0.970, Se=0.836, Sp=0.967, PPV=0.978, NPV=0.772), and titer 9 for criterion 4 (AUC= 0.946, Se=0.928, Sp=0.843, PPV=0.857, NPV=0.921). The difference of 'prevalence estimated by individual and pooled sample showed a minimum of 2% for criteria 2 and a maximum of 9.1:% for criteria 3. These results indicate that the use of pooled sera in HI test for screening IBV infection in laying hen flocks is considered as a cost-effective method of testing large numbers of samples with high diagnostic accuracy.

Morphological, Phylogenetic and Biological Characteristics of Ectropis obliqua Single-Nucleocapsid Nucleopolyhedrovirus

  • Ma Xiu-cui;Xu Hai-Jun;Tang Mei-Jun;Xiao Qiang;Hong Jian;Zhang Chuan-Xi
    • Journal of Microbiology
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    • 제44권1호
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    • pp.77-82
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    • 2006
  • The tea looper caterpillar, Ectropis obliqua, is one of the major pests of tea bushes. E. obliqua single-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus (EcobSNPV) has been used as a commercial pesticide for biocontrol of this insect. However only limited genetic analysis for this important virus has been done up to now. EcobSNPV was characterized in this study. Electron microscopy analysis of the occlusion body showed polyhedra of 0.7 to $1.7\;{\mu}m$ in diameter containing a single nucleocapsid per envelope of the virion. A 15.5 kb genomic fragment containing EcoRI-L, EcoRI-N and HindIII-F fragments, was sequenced. Analysis of the sequence revealed that the fragment contained eleven potential open reading frames (ORFs): lef-1, egt, 38.7k, rrl, polyhedrin, orfl629, pk-1, hoar and homologues to Spodoptera exigua multicapsid NPV (SeMNPV) ORFs 15, 28, and 29. Gene arrangement and phylogeny analysis suggest that EcobSNPV is closely related to the previously described Group II NPV. Bioassays on lethal concentration $(LC_{50}\;and\;LC_{90})$ and lethal time $(LT_{50}\;and\;LT({90})$ were conducted to test the susceptibility of E. obliqua larvae to the virus.

순산소발전 실증사업의 비용-편익 분석 (Cost-Benefit Analysis of Oxy-Combustion Demonstration Project)

  • 진세준;유승훈
    • 에너지공학
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    • 제21권2호
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    • pp.179-186
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    • 2012
  • 온실가스의 증가로 인한 기후변화가 큰 이슈로 대두되고 있는 시점에서 순산소발전 실증사업은 화석에너지를 이용한 발전 부문의 이산화탄소 저감을 위한 한 가지 방안으로 주목을 받고 있다. 순산소발전 실증사업으로 인해 발생하는 전력공급 편익, 온실가스 저감 편익, 환경오염 물질 배출저감 편익, 국내외 시장 진출로 인한 부가가치 창출편익을 추정한다. 이러한 배경 하에서 내부수익률, 편익/비용 비율, 순현재가치의 기준을 이용하여 순산소발전 실증사업의 경제적 타당성을 분석하고자 한다. 순산소발전 실증사업의 경제적 타당성을 분석한 결과, 순산소발전 실증사업의 순현재가치, 편익/비용 비율, 내부수익률은 각각 681,620백만원, 1.69, 21.4%로 분석되었다. 이 분석결과들은 각각 0, 1.0, 5.5%를 초과하므로, 3가지 경제성 판단 지표 모두 본 사업이 경제적 타당성을 확보함을 의미한다. 이러한 분석 결과는 화력발전부문의 온실가스 저감을 위한 정책결정에 있어서 유용하게 활용될 수 있다.

폐광지역 경제자립형 사업에 대한 비용-편익 분석 : 강원도 삼척시를 중심으로 (Cost-benefit analysis of project of promoting the economy in Samcheok City)

  • 정동원;진세준;한종호
    • 에너지공학
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    • 제23권4호
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    • pp.176-182
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    • 2014
  • '폐광지역개발지원에 관한 특별법'에 의거하여 지자체들이 추진 중에 있는 경제자립형 사업은 폐광지역의 경제 활성화를 위한 한 가지 방안으로 주목을 받고 있다. 정부는 경제적 타당성 분석을 통해 지자체의 경제자립형 사업에 대한 예산 지원 유무를 결정하려고 하고 있다. 이러한 배경 하에서 본 논문은 내부수익률, 편익/비용 비율, 순현재가치의 기준을 이용하여 삼척시 경제자립형 사업의 경제적 타당성을 분석하고자 한다. 삼척시는 경제자립형 사업으로 육백산 화훼 휴양단지 조성사업과 유리조형 문화관광 테마파크 조성사업을 추진 중에 있다. 분석 결과, 육백산 화훼 휴양단지 조성사업의 순현재가치는 3,937백만원, 편익/비용 비율은 1.06, 내부수익률은 6.18%였으며, 유리조형 문화과광 테마파크 조성사업의 순현재가치는 8,311백만원, 편익/비용 비율은 1.34, 내부수익률은 9.74%로 분석되었다. 이러한 분석결과들은 각각 0, 1.0, 5.5%를 초과하므로, 3가지 경제성 판단 지표 모두 본 사업이 경제적 타당성을 확보함을 의미한다. 이러한 분석 결과는 삼척시 폐광지역 경제자립형 사업을 위한 정책결정에 있어서 유용하게 활용될 수 있다.

해양쓰레기 오염대응 기술개발사업의 경제적 타당성 분석 (Economic Feasibility Analysis of Marine Debris Pollution Abatement Technology Program)

  • 권영주;박세헌;유승훈
    • 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.274-282
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    • 2014
  • 정부는 해양쓰레기에 대한 모니터링 및 환경영향평가 등 과학적인 연구사업을 통해 해양쓰레기의 영향을 저감시키고 체계적으로 관리하기 위한 해양쓰레기 오염대응 기술개발사업의 시행을 고려하고 있다. 이에 본 연구에서는 이 사업에 대한 경제적 타당성을 분석함으로써 정책판단에 있어서 유용한 정보를 제공하고자 한다. 이를 위해 경제성 분석 지표인 순현재가치, 편익/비용 비율, 내부수익률을 분석하여 제시한다. 분석결과 순현재가치, 편익/비용 비율, 내부수익률은 각각 457억원, 2.72, 17.12%로 산정되어 각각 0, 1.0, 5.5%를 상회하므로 해양쓰레기 오염대응 기술개발사업은 비용-편익 분석을 통과한다. 따라서 해양쓰레기 오염대응 기술개발사업을 시행하는 것은 사회적으로 바람직하다.

위암환자의 술 전 병기 결정에서 PET-CT의 유용성 (Effectiveness of Positron Emission Tomography in the Pre-operative Staging of Gastric Cancer)

  • 박신영;배정민;김세원;김상운;송선교
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제9권3호
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    • pp.110-116
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    • 2009
  • 목적: 위암환자의 수술 전 병기 결정에 있어서 PET의 유용성을 알아보기 위해 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법: 2006년 2월부터 2008년 8월까지 본원에서 위암으로 진단받고 수술 전 병기 결정을 위해 복부 컴퓨터 단층촬영(CT) 및 PET-CT를 모두 시험한 환자 70명을 대상으로 복부 CT 및 PET-CT 영상 자료에 의한 림프절 전이 판정과 수술 후 병리 조직검사에 의한 림프절 전이판정으로 민감도, 특이도, 양성예측도, 음성예측도 및 정확도를 조사하였고 위암의 형태, 조직학적 분류, 크기 등과 FDG섭취 정도와의 차이 등을 알아보았다. 결과: 조기 위암 23예의 경우 복부 CT에서 병변이 진단된 경우는 4명(17.4%), PET-CT에서는 12명(52.1%)이었으며, 진행 위암 47예의 경우 CT에서 26명(56.5%), PET-CT에서 45명(95.7%)으로 PET-CT에서 진단율이 높게 나타났다. 병변의 크기에 따른 분류에서도 복부 CT보다 PET-CT에서 진단율이 높은 것으로 나타났으며, 조기 위암의 경우 진행 위암에 비해 FDG 섭취 정도가 낮았지만 3 cm 이상의 조기 위암의 경우 3 cm 미만의 조기 위암에 비해 FDG가 섭취되는 경우가 더 많았다. CT에서 림프절 병기 결정의 민감도는 40.0%, 특이도는 85.7%, 양성예측도는 85.7%, 그리고 음성예측도는 40.0%였으며, PET-CT에서는 각각 55.6%, 81.0%, 86.2%, 45.9%였다. PET-CT를 통해서만 발견된 전이 병소는 1예(간전이)였으며, 중복암은 직장암 1예와 췌장암 1예가 있었다. 또한 세포조직형에 따른 분류에서도 분화영, 미분화형 모두 PET-CT에서 진단율이 높은 것으로 나타났다. 결론: CT에 비해 PET-CT에서 원발 병소의 진단, 림프절 전이 모두 진단율이 높은 것으로 나타났으며 PET-CT는 전이 병소와 중복암의 발견 등 다른 영상 진단법에 비하여 유리한 점이 있다.

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해양바이오수소개발 사업의 상업생산을 위한 예비경제성평가 (Economic Feasibility Study for Commercial Production of Bio-hydrogen)

  • 박세헌;유영돈;강성균
    • Ocean and Polar Research
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    • 제38권3호
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    • pp.225-234
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    • 2016
  • This project sought to conduct an economic feasibility study regarding the commercial production of bio-hydrogen by the marine hyperthermophilic archaeon, Thermococcus onnurineus NA1 using carbon monoxide-containing industrial off-gas. We carried out the economic evaluation of the bio-hydrogen production process using the raw material of steel mill by-product gas. The process parameter was as follows: $H_2$ production rate was 5.6 L/L/h; the conversion of carbon monoxide was 60.7%. This project established an evaluation criterion for about 10,000 tonne/year. Inflation factors were considered as 3%. The operating costs were recalculated based on prices in 2014. The total investment required for development was covered 30% by capital and 70% by a loan. The operation cost for the 0.5-year test and integration, and the cost for the first three months in the 50% production period were considered as the working capital in the cost estimation. The costs required for the rental of office space, facilities, and other related costs from the construction through to full-scale production periods were considered as continuing expenses. Materials, energy, waste disposal and other charges were considered as the operating cost of the development system. Depreciation, tax, maintenance and repair, insurance, labor, interest rate charges, general and administrative costs, lubrication and miscellaneous expenses were also calculated. The hydrogen price was set at US$ 4.15/kg for the economic evaluation. As a result, the process was considered to be economical with the payback period of 6.3 years, NPV of 18 billion Won and IRR of 26.7%.