• 제목/요약/키워드: Tetrad

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알칼리 금속 이온과 G-quadruplex 결합체에 대한 수용액상에서의 특성 비교 연구

  • 임혜지;김민주;함시현
    • EDISON SW 활용 경진대회 논문집
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    • 제3회(2014년)
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    • pp.29-38
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    • 2014
  • G-quadruplex를 형성하는 DNA연속체는 텔로미어에서 발견된다. 지금까지의 연구 결과에 따르면 G-quadruplex는 다양한 유전질환과 암과의 상관관계가 있으며, 따라서 G-quadruplex에 대한 연구는 제약 개발 분야에서 활발하게 진행되고 있다. G-quadruplex는 두 개 이상의 G-tetrad들이 쌓여서 형성된 복합체를 의미하며, G-tetrad란 4개의 구아닌 염기들이 Hoogsteen의 수소결합 통해, 정사각형의 평면을 이룬 물질을 일컫는다. 이때, 알칼리 금속 이온이 G-quadruplex에서의 G-tetrad 복합체 형성에 중요한 역할을 한다는 선행연구 결과가 있다. 특히, 알칼리 금속 중 $K^+$이 가장 G-quadruplex와 결합을 잘 한다고 알려져 있는데 그 이유에 대한 분자적 관점의 설명이 이루어져 있지 않다. 따라서 본 연구에서는 먼저 G-quadruplex의 기본 구성 단위 구조인 G-tetrad와 알칼리 금속 결합체들의 수용액상에서의 구조적, 열역학적 특징을 정량적으로 비교, 분석하였다. 또한, 양자화학적 방법으로 계산된 수용액 상태에서의 결합구조에 대한 용매화 자유 에너지 계산을 수행하여 G-quadruplex 간의 자기 조립 (self-assembly) 현상을 설명하였다.

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강원도 임원지역 우백질 화강편마암에 나타난 희토류원소 테트라드 효과의 지구화학적 의의 (Geochemical Implication of Rare Earth Element Tetrad Effect from a Leucocratic Granite Gneiss in the Imweon Area, Gangwon Province, Korea)

  • 이승구;김건한;송용선;김남훈;박계헌
    • 암석학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.27-37
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    • 2007
  • 강원도 임원진 부근에 분포하는 선캠브리아기 우백질 화강편마암체 노두에서의 희토류원소 분포도가 갖는 지구화학적 의의에 대해 토의하고자 한다. 이 노두는 흑운모 편마암을 포획암으로 갖고 있으며, 이 흑운모 편마암과 접촉하고 있는 우백질 화강편마암은 주변에 비해 구성광물의 입자가 큰 거정질이고, 접촉변성 작용의 흔적은 관찰되지 않는다. 이 노두에서의 우백질 화강 편마암은 풍화도와 관계없이 전반적으로 Eu의 강한 부(-)의 이상과 더불어 희토류원소의 M-형의 테트라드 효과라 불리우는 특이한 희토류원소 분포도 특성을 갖고 있다. 그리고 흑운모 편마암과의 접촉부에서는 M-형의 테트라드 효과가 약화되었거나 혹은 부분적으로 W-형의 테트라드 효과가 관찰된다. 우백질 화강편마암에서의 Eu의 부의 이상은 Ca/Sr비의 변화뿐만 아니라 테트라드 효과의 존재와도 밀접한 연관성을 보여준다. 이는 임원지역의 노두에서 관찰된 희토류원소의 테트라드 효과가 우백질 화강편마암의 분화과정상에서 형성된 것이며, 암석의 풍화가 Eu의 이상 혹은 Ce의 이상의 변화를 가져올 수는 있지만 희토류원소의 테트라드 효과를 만들거나 크기를 변화시킨 요인은 아님을 지시해준다.

수도의 감수분열기 및 등숙기에 있어서 온도반응에 관한 연구 제1보 수도 indica $\times$ Japonica품종의 감수분열기에 있어서의 저온의 영향 (Studies on the Effects of Temperature During the Reduction Division and the Grain Filling Stage in Rice Plants I. Effect of Temperature at the Reduction Division Stage in Indica-Japonica Crosses)

  • Kim, Kyu-Chin
    • 한국작물학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.41-57
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    • 1983
  • 수도 Indica$\times$Japonica 품종을 중심으로 유형이 다른 품종을 공시 저온에 민감한 시기를 외적으로 손쉽게 판별할 수 있는 방법과 감수분열기에 있어서 저온의 영향을 구명하고자 phytotron을 이용하여 정밀시험을 시도한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 수도생육기간중에서 저온에 가장 민감한 Tetrad phase는 엽이간장이 진흥은 -12cm, IR 36 -3cm 수원 26004 -9cm, 수원 258호 -3cm, 밀양 29호 -6cm, Lengkwang+1cm 였다. 2. 본시험결과 Tetrad phase는 모든 품종에서 내영(palea)의 길이가 최대에 달하는 개화기를 100로 하였을 때의 50-60% 신장되었을 때 나타나고 있었다. 3. 저온에 의한 영화의 퇴화율은 15$^{\circ}C$에서 통일품종 및 인도형품종에서는 대단히 높았으나 Japonica품종(진흥)과 Indica품종(Lengkwang)에서는 비교적 낮었다. 4. 수도감수분열기에 있어서 계속 $15^{\circ}C$로 7일이상 저온처리는 수도의 저온에 한계온도를 넘어서 내냉성의 품종간 차이를 구별하기 어려웠으나 4일간의 저온처리에서는 품종간 차이가 뚜렷하여 불완율이 진흥; 46.8%, IR 36; 67.6% 수원 26004 ; 60.9% 수원 258 ; 60.0% 밀양 29호 ; 62.2%, Lengkang 27.3%였다. 5. 하분모세포의 발육단계의 Tetrad-1st contraction phase에서의 저온은 임실율을 가장 낮게 하였으며 이 시기를 전후로 멀어질수록 임실율은 높아졌다. 6. 내영의 길이는 영화분화에서 개화기까지 직선적으로 신장하였고 엽이간장의 신장과는 정의 상관관계가 인정되었다.

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Pollen Morphology of the Genus Rhododendron (Ericaceae) in Korea

  • Park, Joon-Moh;Song, Un-Sook
    • 한국산림과학회지
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    • 제99권5호
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    • pp.663-672
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    • 2010
  • The pollen morphology of eleven species and three forms of the genus Rhododendron (Ericaceae) in Korea was examined using light, scanning electron and transmission electron microscopy. The pollen grains are grouped in permanent tetrahedral tetrads; viscin threads are present on the tetrads. The hexacolporate tetrads are of tricolporate monads whereby the apertures form in pairs at six points in the tetrad. The exine sculpture pattern is rugulate, scabrate or verrucate on mesocolpium but psilate, rugulate or microscabrate around the aperture on apocolpium. The exine of Korean Rhododendron pollen consists of tectum, columella, foot layer and endexine. The surface of viscin threads is more or less smooth. The threads are sometimes tangled together and occasionally divided into strands. Six types are recognized based on the pollen morphology. The types are: (1) Micranthum-type (rugulate mesocolpium and psilate apcolpium), (2) Tomentosum-type (rugulate mesocolpium and apocolpium), (3) Aureum-type (scabrate mesocolpium and rugulate apocolpium), (4) Brachycarpum-type (scabrate mesocolpium and rod shaped-microscabrate apocolpium), (5) Schlippenbachiitype (scabrate mesocolpium and round-microscabrate apocolpium) and (6) Weyrichii-type (verrucate mesocolpium).

A FULL CHARGE SEPARATION OVER THE TWO SAME CHROMOPHORES IN A PHOTOSYNTHETIC TETRAD

  • Osuka, Atsuhiro;Marumo, Shinji;Okada, Tadashi;Taniguchi, Seiji;Mataga, Noboru;Ohno, Takeshi;Nozaki, Koichi;Yamazaki, Iwao;Nishimura, Yoshinobu
    • Journal of Photoscience
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    • 제4권3호
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    • pp.113-119
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    • 1997
  • The synthesis and excited-state dynamics are described for a tetrad (ZC - ZP - ZP - I) consisting of zinc chlorin (ZC), zinc porphyrin (ZP), zinc porphyrin (ZP), and pyromellitimide (I), which upon photoexcitation provides a fully charge-separated state (ZC$^+$- P - ZP - l$^- $) with lifetimes of 230 $\mu$s in THF and > 50$ \mu$s in DMF at room temperature via a stepwise electron-transfer relay that has been detected by the ps-time resolved transient absorption spectroscopy.

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한국산 노루발과(Pyrolaceae)의 화분분류학적 연구 (Palynotaxonomic Study on the Korean Pyrolaceae)

  • 정규영;남기흠;박명순
    • 한국자원식물학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.193-200
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    • 2007
  • 국내 분포하는 것으로 알려진 노루발과 7분류군의 화분에 대하여 분류학적 가치를 파악하기 위하여 광학현미경과 주사전자현미경으로 관찰하였다. 성숙한 화분의 단위(pollen unit)는 Pyrola속의 호노루발[P. dahurica(Andres) Kom.], 분홍노루발[P. incarnata(DC.) Fisch. ex Kom.], 노루발(P. japonica Klenze ex Alefeld), 주걱노루발(P. minor L.), 콩팥노루발(P. renifolia Max.)에서 사립(tetrad), Orthilia속의 새끼노루발[P. secunda(L.) House]에서 단립(monad), Chimaphila속의 매화노루발(C. japonica Miq.)에서 사립들이 엉성하게 모여 다립(polyad)을 형성하였다. 이와 같이 노루발과의 성숙한 화분의 단위는 과내 속을 구분하는 중요한 형질로 판단되었으며, 이를 근거로 새끼노루발의 학명은 Pyrola secunda L.보다는 Orthilia secunda(L.) House가 적합한 것으로 생각되었다. 화분의 크기와 삼공구형(tricolporate)인 발아구의 크기, 표벽 무늬는 분류군 간에 다소 차이를 나타냈으며, 호노루발과 콩팥노루발, 분홍노루발, 주걱노루발의 표면무늬는 기존 보고와 다소 상이하였다. 본 연구에서 취급된 분류군들의 화분은 성숙한 화분의 구성단위가 각기 사립에서 단립과 다립으로, 발아구의 형태가 공구형에서 공형으로의 진화경향성을 추론할 수 있었다.

Nucleocapsid Amino Acids 211 to 254, in Particular, Tetrad Glutamines, are Essential for the Interaction Between the Nucleocapsid and Membrane Proteins of SARS-Associated Coronavirus

  • Fang, Xiaonan;Ye, Lin-Bai;Zhang, Yijuan;Li, Baozong;Li, Shanshan;Kong, Lingbao;Wang, Yuhua;Zheng, Hong;Wang, Wei;Wu, Zhenghui
    • Journal of Microbiology
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    • 제44권5호
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    • pp.577-580
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    • 2006
  • GST pull-down assays were used to characterize the SARS-CoV membrane (M) and nucleocapsid (N) interaction, and it was found that the amino acids 211-254 of N protein were essential for this interaction. When tetrad glutamines (Q) were replaced with glutamic acids (E) at positions of 240-243 of the N protein, the interaction was disrupted.

분열효모 Schizosaccharomyces pombe에서 spThp1 유전자 결실돌연변이의 제조와 특성 조사 (Construction of Schizosaccharomyces pombe spThp1 Null Mutants and its Characterization)

  • 윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.149-152
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    • 2006
  • 분열효모인 Schizosaccharomyces pombe에서 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 관여할 것으로 여겨지는 spThp1 유전자의 결실돌연변이주(deletion mutant)를 제조하여 그 특성을 조사하였다. 이배체(diploid) 균주의 한 spThp1 유전자를 결실시킨 후 4분체분석(tetrad analysis)을 수행한 결과, 이 유전자는 생장에 필수적이지 않았다. 또한 결실돌연변이주는 mRNA 수송도 큰 결함을 보이지 않았다. 하지만 spThp1 는 mRNA의 운반체를 암호화하고 있는 spMex67와 합성치사(synthetic lethality)를 보였다. 이 결과는 분열효모의 spThpl도 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 역할을 하고 있음을 암시한다.

mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 관여하는 spSac3 유전자의 결실돌연변이 제조와 특성 조사 (Construction of spSac3 Null Mutants Defective in mRNA Export)

  • 강숙희;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.153-155
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    • 2006
  • mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 관여하는 발아효모 Saccharomyces cerevisiae의 SAC3유전자와 유사한 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전자 (spSac3로 명명)의 결실돌연변이주 (knockout mutant)를 제조하여 그 특성을 조사하였다. S. pombe의 이배체 (diploid) 균주에서 한 spSac3 유전자만을 결실시킨 후 4분체분석 (tetrad analysis)을 수행한 결과, 이 유전자는 성장에 필수적이었다. 또한 in situ hybridization을 통해 세포 내의 poly(A)+ RNA분포를 살펴본 결과, spSac3 유전자의 결실돌연변이주는 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 이상이 있었다. 이와 같은 결과들은 spSac3 유전자 역시 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 매우 중요한 역할을 담당하고 있음을 시사한다.

효모의 mating pheromone 신호전달과정에 관여하는 유전자의 돌연변이 분리 및 분석 (Isolation and Characterization of the Mutants in the Genes Involved in Mating Pheromone Signalling)

  • 김지혜;김환규;장광엽
    • 한국균학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.266-275
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    • 1991
  • 효모의 mating pheromone에 의한 세포내 Slgnal을 전달하는 물질을 coding 하거나 조절할 수 있는 유전자에 대한 정보를 얻기 위해서 효모에서 G-protein의 ${\alpha}-subunit$를 coding 하는 유전자 CDC70에 돌연변이가 얼어난 균주 $A14-3(MAT{\alpha},\;cdc70-5)$에 UV를 조사하여 돌연변이 cdc70-5를 억제할수 있는 또 다른 돌연변이를 획득하였다 . 돌연변이 cdc70-5의 표현형은 온도 감수성 (temperature sensitivity)이며, $38^{\circ}C$에서 배양하면 세포주기가 G1에서 정지되고 shmoo모양을 보인다 . 균주 A14-3에서 UV를 조사하였을 때 $38^{\circ}C$에서 colony를 형성할 수 있고 세포분열이 정상적으로 진행되어 출아를 하고 있다는 것은 새로운 돌연변이가 cdc70-5 의 표현형을 억제 한다는 사실을 의미한다 . 이러한 억제돌연변이 중 signal transducer와 직접적으로 관련이 없는 유전자들인 $sir^-$$mat{\alpha}2^-$ 돌연변이를 배제한 다음 선택된 15개의 돌연변이들를 중심으로 분석을 행하였다 . 어느 유전자에서 유발 되었는지 그리고 유전자 종류는 몇 가지나 되는지를 암기 위하여 tetrad analysis를 통해 연관여부를 조사하여 분리된 15개의 돌연변이중 12개는 4개의 연관군(sga1, sga2, sga3, sga4)에 속함을 알았다.

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