• 제목/요약/키워드: avermectin

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Comparative Transcriptome Analysis for Avermectin Overproduction via Streptomyces avermitilis Microarray System

  • Im, Jong-Hyuk;Kim, Myung-Gun;Kim, Eung-Soo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권3호
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    • pp.534-538
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    • 2007
  • Avermectin and its analogs are major commercial antiparasitic agents in the fields of animal health, agriculture, and human infections. To increase our understanding about the genetic mechanism underlying avermectin overproduction, comparative transcriptomes were analyzed between the low producer S. avermitilis ATCC31267 and the high producer S. avermitilis ATCC31780 via a S. avermitilis whole genome chip. The comparative transcriptome analysis revealed that fifty S. avermitilis genes were expressed at least two-fold higher in S. avermitilis ATCC31780. In particular, all the avermectin biosynthetic genes, including polyketide synthase (PKS) genes and an avermectin pathway-specific regulatory gene, were less expressed in the low producer S. avermitilis ATCC31267. The present results imply that avermectin overproduction in S. avermitilis ATCC31780 could be attributed to the previously unidentified fifty genes reported here and increased transcription levels of avermectin PKS genes.

Production of Avermectin from Streptomyces avermitilis NRRL8165 by optimization of medium composition

  • Shin, Sang-Heum;Ko, Kwon-Hye;Kang, Hyun-Woo;Kang, Heui-Yun;Kim, Yong-Sung;Ryu, Yeon-Woo
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2005년도 생물공학의 동향(XVI)
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    • pp.152-156
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    • 2005
  • 본 연구에서 수행한 avermectin 생산을 위한 배지 최적화에서 기존의 총 avermectin의 함량 10 mg/L를 470 mg/L까지 증가시켰으며, 이 중 광범위 활성을 가지는 avermectin B1도 50%에 달했다. 최적화된 배지 조성은 50 g/L fructose, 30 g/L malt extract, 5 g/L casamino acid, 2.5 g/L PEG 3,350, and 1 g/L $K_{2}HPO_{4}$이다. $K_{2}HPO_{4}$와 fructose, malt extract가 avermectin 생합성에 크게 작용하는 것으로 추정된다.

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사과 및 토양중 avermectin B1의 간편한 잔류 분석법 개발과 비교 (Development and comparison of convenient residue analysis for avermectin B1 in apple and soil)

  • 이강봉;김용두;심재한;서용택
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제35권2호
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    • pp.115-121
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    • 1992
  • 광범위한 살비, 살충제로 사용되는 avermectin의 잔류분석을 위해 기존의 2가지 분석법과 이를 간략하게 변경시킨 새로운 방법을 이용하여 그 분석능을 검토하였다. 종래의 형광분석법은 장시간이 소요되고 재현성이 낮은 반면 개선시킨 trifluoroacetylation 방법은 재현성과 안정성이 뛰어났다. 하지만 이 방법 역시 복잡한 과정과 비용이 소모되는 단점이 있어 본 실험에서 더욱 간략하게 변경시킨 방법을 사용하여 이들 방법들의 검출능과 회수율을 비교하였다. 이들 3가지 방법의 회수율은 유사했는데 형광분석법에 의한 사과에서의 회수율은 1 ppb와 10 ppb에서 각각 평균 90.3%와 88.2%를 나타냈고 복합 형광분석법은 5 ppb와 25 ppb에서 모두 평균 100.7%를 나타냈다. 새로이 개발된 분석법에서의 회수율은 사과에 대하여 5 ppb와 25 ppb에서 각각 95.0, 99.0%였고 토양에서는 각각 96.0%와 92.8%였다.

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Avermectin을 생산하는 Streptomyces avermitilis에서의 Proteomics-guided AfsR2-dependent 유전자의 발현 (Functional Expression of Proteomics-guided AfsR2-dependent Genes in Avermectin-producing Streptomyces avermitilis)

  • 김명근;박현주;임종혁;김응수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.211-215
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    • 2006
  • S. lividans에서 클로닝된 조절유전자인 afsR2를 과발현시 나타나는 up-regulated protein과 down-regulated protein 관련 유전자들을 proteomics 방법으로 선별하였고[3], 이를 방선균 발현벡터인 pSE34를 이용하여 제작된 pPNP, pGPD를 S. avermitilis에 형질전환시켜 avermectin 및 이차대사산물의 생산량 차이를 비교 분석하였다. 그 결과 up-regulated protein으로 예상되던 PNP는 wild-type S. avermitilis에서만 제한적으로 avermetin-type 대사산물의 생산성 향상을 촉진시켰으며, 이와 반대로 down-regulated protein으로 예상되었던 GPD는 avermectin-type 대사산물의 생산량을 wild type S. avermitilis에서는 4배, over-producer S. avermitilis에서는 2.5배 증가시켰다. 본 연구결과는, 방선균 조절 단백질들이 이차대사산물의 종류 및 생합성 기작에 따라 전혀 다르게 작용될 수 있음을 암시하며, 향후 이들 조절 단백질들에 대한 보다 구체적인 분자수준에서의 연구 필요성을 제시하고 있다.

Alternative Production of Avermectin Components in Streptomyces avermitilis by Gene Replacement

  • Yong Joon-Hyoung;Byeon Woo-Hyeon
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권3호
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    • pp.277-284
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    • 2005
  • The avermectins are composed of eight compounds, which exhibit structural differences at three positions. A family of four closely-related major components, A1a, A2a, B1a and B2a, has been identified. Of these components, B1a exhibits the most potent antihelminthic activity. The coexistence of the '1' components and '2' components has been accounted for by the defective dehydratase of aveAI module 2, which appears to be responsible for C22-23 dehydration. Therefore, we have attempted to replace the dehydratase of aveAI module 2 with the functional dehydratase from the erythromycin eryAII module 4, via homologous recombination. Erythromycin polyketide synthetase should contain the sole dehydratase domain, thus generating a saturated chain at the C6-7 of erythromycin. We constructed replacement plasmids with PCR products, by using primers which had been derived from the sequences of avermectin aveAI and the erythromycin eryAII biosynthetic gene cluster. If the original dehydratase of Streptomyces avermitilis were exchanged with the corresponding erythromycin gene located on the replacement plasmid, it would be expected to result in the formation of precursors which contain alkene at C22-23, formed by the dehydratase of erythromycin module 4, and further processed by avermectin polyketide synthase. Consequently, the resulting recombinant strain JW3105, which harbors the dehydratase gene derived from erythromycin, was shown to produce only C22,23-unsaturated avermectin compounds. Our research indicates that the desired compound may be produced via polyketide gene replacement.

Two Threonine Residues Required for Role of AfsKav in Controlling Morphogenesis and Avermectin Production in Streptomyces avermitilis

  • Rajkarnikar, Arishma;Kwon, Hyung-Jin;Ryu, Yeon-Woo;Suh, Joo-Won
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권9호
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    • pp.1563-1567
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    • 2007
  • AfsKav is a eukaryotic-type serine/threonine protein kinase, required for sporulation and avermectin production in Streptomyces avermitilis. In terms of their ability to complement SJW4001 (${\Delta}afsK$-av), afsK-av mutants T165A and T168A were not functional, whereas mutants T165D and T168D retained their ability, indicating that Thr-165 and Thr-168 are the phosphorylation sites required for the role of AfsKav. Expression of the S-adenosylmethione synthetase gene promoted avermectin production in the wild-type S. avermitilis, yet not in the mutant harboring T168D or T165D, demonstrating that tandem phosphorylation on Thr-165 and Thr-168 in AfsKav is the mechanism modulating avermectin production in response to S-adenosylmethione accumulation in S. avermitilis.

SUPPLEMENTATION OF EARLY WEANED CALVES WITH COMBINATIONS OF RUMEN MODIFIERS, COTTONSEED MEAL AND MOLASSES AND TREATMENT WITH AVERMECTIN B1

  • Burns, B.M.;Lindsay, J.A.;Hobbs, K.J.;Reid, D.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제3권4호
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    • pp.337-341
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    • 1990
  • An investigation was conducted to determine whether the rumen modifiers lasalocid and avoparcin, when included in molasses/urea based supplements, enhanced liveweight performance, in early weaned calves. As part of the study the broad-spectrum parasiticle Avermectin B1 was given to the calves to assess any undesirable side effects on animals of less than four months of age. There were no significant (p>0.05) liveweight responses to supplementation when the rumen modifiers lasalocid and avoparcin were included in supplement rations. Lasalocid reduced supplement intake, however, it had no adverse effect on liveweight gain. Avoparcin substantially improved growth when cottonseed meal was included in the ration. Weaners treated with Avermectin B1 tended to show a greater liveweight gain than untreated weaners during the experiment (p<0.10) and no adverse side effects were noted.

Enhancement of Avermectin Production by Introduction of a Foreign Regulatory Gene in Streptomyces avermitilis

  • 황용순;이재영;김상수;김응수;최차용
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2000년도 춘계학술발표대회
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    • pp.195-198
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    • 2000
  • Production of eight avermectin components was improved in Streptomyces avermitilis wild type strain (ATCC31267) and high producing mutant strain (ATCC31780) when transformed with a foreign regulatory gene, afsR2 of Streptomyces lividans. Wild type and the high producing strain of S. avermitilis transformed with multiple copies of afsR2 improved total avermectin productions by 2.3 fold and 1.5 fold, respectively. In both of wild type and the high producing transformants carrying afsR2, glycerol was proved to be the best carbon source for the stimulation of avermectin production.

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배지 및 유가식 회분배양 최적화에 의한 Streptomyces avermitilist 의 Avermectin B1a 생산성 향상 (Enhanced Production of Avermectin B1a with Streptomyces avermitilis by Optimization of Medium and Glucose Feeding)

  • 이병규;김종균;강희일;이종욱
    • 미생물학회지
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    • 제37권2호
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    • pp.158-163
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    • 2001
  • Avermectin B1a의 생산성 향상을 위하여 무기인의 영향을 조사하고, 주요 유기질소원의 최적농도를 response surface methodology를 적용하여 구하였다. 1.5 g/ι의 농도로 무기인을 아버멕틴 생산배지에 첨가하였을 때 B1b 성분의 구성비가 5.8%에서 3%로 감소하였으며 B1a 생성은 영향을 받지 않았다. 배지의 주요성분인 대두분, 면실분, 효모추출물 중 아버멕틴 생성에 가장 큰 영향을 끼치는 유기질소원은 대두분이었다. 실험실 규모 발효조에서 Streptomyces avermifilis YA99-40의 유가식 회분배양에 의해 아버멕틴 생산성을 회분배양에 비해 44.8% 증가시킬 수 있었다. 발효조 배양시작 후 136, 206 시간에 각각 30, 20 g/ι의 당을 추가하는 유가식 회분배양을 실시하였을 때 B1a 성분의 최대 생산성은 회분배양 대비 86.3% 증가하였으며 생성된 총 아버멕틴 중 B1a의 구성비율도 화분배양에 비해 38%에서 45%로 향상되었다. 이 같은 결과는 산업적인 규모로 아버멕틴의 생산성을 향상시키는데 유용하게 적용시킬 수 있다.

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Streptomyces avermitilis에서 olmA5 Gene의 Knock-out에 의한 Oligomycin 합성 억제 (Inhibition of Oligomycin Biosynthesis by olmA5 Gene Knock-out in Streptomyces avermitilis)

  • 강현우;유연우
    • KSBB Journal
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    • 제24권3호
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    • pp.279-286
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    • 2009
  • 방선균은 다양한 생리활성 물질을 이차대사산물로 생산하는 산업적으로 매우 유용한 미생물이다. 이에 따라 많은 연구진들이 방선균에 대한 분자생물학적 연구와 산업적 이용에 대한 연구들을 수행하고 있다. 방선균 중에서도 S. avermitilis는 강력한 구충효과가 있는 avermectin을 생산하지만, 또한 포유동물 세포의 미토콘드리아에서 산화적 인산화반응을 억제하는 oligomycin도 함께 생성된다. 따라서 S. avermitilis에서 oligomycin의 생성을 제거시키기 위하여 oligomycin synthetase gene을 disruption 시키기 위한 연구를 수행하였다. 이를 위하여 S. avermitilis로부터 cloning 한 oligomycin synthetase gene (olmA5)의 중앙부분에 apramycin resistance gene을 끼워 넣어 integration vector로 구축한 후에 S. avermitilis의 chromosomal DNA와의 homologous recombination에 의하여 olmA5 gene의 disruption을 유도하였다. Disruption mutants (olmA5::apra)는 PCR을 통해 olmA5 gene의 위치에 apramycin resistance gene이 존재하는 것으로 확인하였고, 또한 HPLC 분석을 통해 oligomycin 생합성이 완전히 제거된 것임을 확인하였다. 그러나 disruption mutant (olmA5::apra)를 이용하여 avermectin 만을 생산할 수 있었으나, avermectin의 생산량에는 거의 변화가 없었다. 이러한 mutants는 산업적으로 avermectin을 생산하기 위한 균주 개량의 훌륭한 source가 될 수 있을 것이다.