Nucleotide Sequence of Mating Locus of Schizophyllum commune Indigenous to North America

북미자생 치마버섯의 Mating Locus의 염기서열

  • Park, Dong-Cheol (Department of Food Science & Technology, Kim-Cheon College) ;
  • Lee, Sang-Sun (Biological Science and Education, Korea National University of Education) ;
  • Lee, In-Seon (Department of Food Technology & Science, Keimyung University) ;
  • Kim, Hyeun-Jeong (Department of Food Technology & Science, Keimyung University) ;
  • Lee, Kap-Rang (Department of Food & Nutition, Yeung-Nam University)
  • 박동철 (김천대학 식품가공과) ;
  • 이상선 (한국교원대학교 대학원 생물과학 및 생물교육학) ;
  • 이인선 (계명대학교 식품가공과) ;
  • 김현정 (계명대학교 식품가공과) ;
  • 이갑랑 (영남대학교 식품영양학과)
  • Published : 2000.04.30

Abstract

This study was carried out to compare DNA sequence of mating type locus concerning with direct formation of fruiting body in Schizophyllum commune which is growing in North America with that of same species growing in South America. The nucleotide sequence appeared to have about 96% homology to 1-71 $A{\alpha}3$ allele from South America strain, showing a conservative feature. The polypeptide sequence showed about 82% homology when compared partially with mating activity region of 1-71 $A{\alpha}3$ allele. In addition, this polypeptide sequence indicated 74% and 82% identity in homeodomain and acidic-rich regions known as a transcription factor respectively.

Cosmid clone으로부터 mating activity를 가지는 pSC13의 양 말단은 1-71 $A{\alpha}3$ 교배유전자좌 Z3부위 2,430 bp와 Y3 region 8,160 bp 부근에서 homology를 지니는 것으로 나타나 교배활성에 필요한 모든 부위를 함유하는 것으로 사료되었다. 그리고 pSCE2는 1-71 $A{\alpha}3$의 Y region의 6,080 bp 부근에서 거의 완전한 homology를 가지는 것으로 보아 $A{\alpha}3$의 Y region을 함유하고 있음을 알 수 있으며, 또한 pSCE1도 MEP의 일부 sequence와도 거의 완전한 homology를 가지는 것으로 나타나 1-71 $A{\alpha}3$ 교배유전자좌와 모두 유사한 염기서열를 모두 지니면서 북미자생 치마버섯의 교배유전자좌의 염기배열이 남미자생의 것과 거의 유사한 분자적 구조를 지니고 있음을 나타내었다. 결정된 DNA sequence는 3265 bp로서 남미산 치마버섯 1-71 stain의 mating활성을 나타내는 $A{\alpha}3$ locus 염기서열중에 Z region과 거의 완전한 약 96%의 homology를 나타내었다. 또한 Polypeptide sequence비교에서도 약 82%의 높은 homology를 나타내었으며, 특히 transcription regulator로 알려진 homeodomain 및 acidic region에서는 각각 약 74%. 82%의 상당히 높은 비율의 homology를 지니고 있음이 확인되었다. 이러한 결과로 보아 남미와 북미의 대륙간에 자생하는 같은 allele type간에도 상당히 높은 비율의 교배유전자좌의 보존이 이루어지고 있음을 알 수 있다.

Keywords

References

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